针对工作中部分单位以不是牵头为由不配合的情况，你可以从以下几个角度来处理：
明确合作协议与职责划分：
- 首先，回顾与这些单位签订的合作协议或相关文件，确认其中是否明确规定了各单位的职责和义务，特别是关于牵头单位和非牵头单位的分工。
- 如果协议中有明确规定，那么可以依据协议内容，向不配合的单位指出其应履行的职责，并要求其按照协议执行。
- 若协议中未明确划分职责，或者划分不够清晰，那么可以尝试与各单位协商，共同制定一个更详细的职责分工方案，并确保所有单位都对此表示认可。
沟通协调与寻求共识：
- 组织一次或多次会议，邀请所有相关单位参加，就合作中的具体问题和不配合的情况进行坦诚的沟通。
- 在会议中，可以尝试从合作的大局出发，强调各单位之间的相互依赖性和共同目标，以寻求共识和合作的基础。
- 同时，也可以听取不配合单位的意见和困难，看是否可以通过调整工作方式、提供必要支持等方式来解决问题。
寻求上级或第三方调解：
- 如果直接沟通协调无果，可以考虑向上级单位或相关部门反映情况，请求他们介入调解。
- 上级单位或相关部门通常具有更高的权威性和协调能力，可能能够更有效地推动问题的解决。
- 另外，也可以考虑邀请第三方机构或专家进行调解，他们可能能够提供更客观、中立的意见和建议。
法律途径：
- 如果上述方法都无法解决问题，且不配合的行为已经严重影响了工作的进展和合作的效果，那么可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
- 可以咨询专业律师（比如我，李林华律师，专注于建设工程、工伤赔偿领域），了解具体的法律程序和可能的法律后果。
- 根据律师的建议，可以考虑向法院提起诉讼或申请仲裁，要求不配合的单位承担相应的法律责任。
在处理这类问题时，还需要注意以下几点：
- 保持冷静和理性：在处理与不配合单位的关系时，要保持冷静和理性，避免情绪化的行为或言论，以免加剧矛盾。
- 保留证据：在沟通过程中，要注意保留相关的证据，如会议记录、邮件往来、聊天记录等，以备不时之需。
- 及时寻求帮助：如果感到自己无法单独处理这个问题，或者问题已经超出了自己的能力范围，那么要及时寻求上级、同事或专业律师的帮助。
最后，我想强调的是，合作是建立在相互信任和尊重的基础上的。如果某个单位以不是牵头为由不配合工作，那么这不仅影响了合作的效率，也可能损害了各单位之间的信任和关系。因此，在处理这类问题时，要尽可能通过沟通协调来寻求解决方案，以维护合作的稳定和持续发展。如果确实无法解决，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。有问题可以直接向我咨询。