结论：在厂里上班3天因体检不合格被退工，是否给退工单需分情况讨论，主要取决于工厂的规章制度以及双方签订的劳动合同或入职协议中的相关约定。
分析说明：
工厂规章制度与劳动合同约定：
- 如果工厂的规章制度或双方签订的劳动合同、入职协议中明确规定了因体检不合格可以解除劳动关系，并且会出具退工单，那么工厂应当按照约定执行，给员工出具退工单。
- 如果规章制度或合同中没有明确规定，但工厂实际操作中对于因体检不合格退工的员工会出具退工单，那么员工也有权要求工厂出具。
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者解除劳动关系时，应当出具解除或者终止劳动合同的证明，即退工单（或类似文件）。这是用人单位的法定义务，旨在保障劳动者的合法权益，便于其后续就业或享受相关待遇。
- 然而，该法律并未明确规定在何种具体情况下（如体检不合格）必须出具退工单，因此具体是否出具还需参考工厂的规章制度和劳动合同约定。
实际操作建议：
- 如果员工因体检不合格被退工，但工厂未出具退工单，员工可以首先与工厂进行沟通协商，要求工厂按照法律法规和合同约定出具退工单。
- 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
特殊场景提醒：
- 如果员工在入职前已经明确知晓体检不合格将不被录用，但仍然选择入职并在短时间内因体检不合格被退工，这种情况下工厂可能更倾向于不出具退工单（除非合同或规章制度中有明确规定）。但即便如此，员工仍有权要求工厂说明退工原因，并保留相关证据以备不时之需。
后续行动建议：
- 如果你正面临这样的情况，建议首先查看自己的劳动合同或入职协议中是否有关于体检不合格退工及退工单出具的相关约定。
- 同时，也可以咨询工厂的人力资源部门或相关负责人，了解工厂的具体操作流程和规定。
- 如有必要，可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我），以更好地维护自己的合法权益。
如有其他劳动工伤相关的问题，也可以直接向我咨询。