结论前置：农村子女继承父母房子后，不动产证上规定20年不能转让是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若该规定源于合法有效的遗嘱或赠与合同中的限制条款
   根据《民法典》第1133条，自然人可以立遗嘱处分个人财产，并附义务或条件。若父母在遗嘱中明确“子女继承房屋后20年内不得转让”，且该条款不违反法律强制性规定（如不损害公共利益、不违背公序良俗），则该限制合法有效。子女作为继承人需遵守遗嘱内容，否则可能面临遗产分割纠纷或承担违约责任。
   例外情形：若限制条款导致子女生活严重困难（如无其他住房），可依据《民法典》第1141条“必留份”制度，主张调整或撤销限制。

2. 若该规定源于地方性法规或行政规章的强制性要求
   需核查该规定是否符合上位法（如《民法典》《土地管理法》）。例如：

   • 集体土地使用权限制：农村房屋与宅基地使用权捆绑，若地方规定“宅基地上房屋转让需满足特定年限”（如20年），需符合《土地管理法》第62条“农村村民一户只能拥有一处宅基地”的立法目的，且不得以“转让限制”变相剥夺村民财产权。
     
   • 合法性审查：若地方规定无上位法依据，或通过限制转让达到“强制留村”等目的，可能因违反《立法法》第80条“没有法律、行政法规依据，地方性法规不得设定减损公民权利的规范”而被认定无效。

3. 若该规定源于不动产登记机构的格式条款或操作惯例
   不动产登记机构无权自行设定转让限制。根据《不动产登记暂行条例》第8条，登记事项需以法律、行政法规为依据。若登记机构以“内部规定”为由限制转让，可依据《行政诉讼法》第12条提起行政诉讼，要求撤销违法登记行为。

建议行动：

• 核查限制来源（遗嘱、合同、地方规定或登记行为）；
  
• 收集证据（如遗嘱文本、地方政策文件、不动产证登记内容）；
  
• 咨询专业律师，通过法律程序确认限制合法性或主张权利。
  

如有进一步疑问，可直接向我提问，我会结合具体证据为您详细分析。