当中标单位未在中标通知书规定的期限内签订合同时，招标单位可以依据相关法律法规，采取一系列措施来确保招标活动的严肃性和公正性，并保障自身的合法权益。以下是一些具体的处理方式：
一、招标人层面的处理措施
沟通协商：
- 首先，招标单位应尝试与中标单位进行沟通，了解其未签订合同的具体原因。这有助于判断中标单位是否存在合理的延迟理由，如内部流程问题等。
- 在沟通的基础上，招标单位可以给予中标单位一定的合理期限，要求其尽快按照规定签订合同。若中标单位因内部流程问题导致延迟，双方可协商新的签订日期。
发送书面警告：
- 若沟通无果，招标单位应向中标单位发送正式的书面警告函。在警告函中，应明确指出中标单位的违约行为，并要求其在规定时间内签订合同，否则将承担法律责任。
取消中标资格与没收保证金：
- 若中标单位在合理期限内仍未签订合同且无正当理由，根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第七十四条，招标单位有权取消其中标资格。
- 同时，招标单位可以不予退还中标单位的投标保证金或履约保证金（如已提交），以作为对其违约行为的惩罚。
重新招标：
- 在取消中标资格后，招标单位需重新组织招标活动，选择新的中标单位，以确保项目能够顺利进行。
保留证据与寻求法律救济：
- 在处理过程中，招标单位应保留所有相关证据材料，如沟通记录、书面警告函、中标通知书等。
- 若中标单位的违约行为给招标单位造成了损失，招标单位可以在必要时向法院提起诉讼，要求中标单位承担违约责任并赔偿损失。
二、行政监督部门的处理措施
责令改正：
- 对于依法必须进行招标的项目，若中标单位存在不与招标人订立合同等违法行为，行政监督部门有权责令其改正。
罚款：
- 除责令改正外，行政监督部门还可以对中标单位处以中标项目金额10‰以下的罚款，以促使其遵守法律法规。
不良记录与信用惩戒：
- 行政监督部门可将中标单位的违约行为记入不良记录，并通过信用惩戒机制对其进行约束和惩罚。例如，将其列入黑名单、限制其参与未来招标活动等。
综合建议
在处理中标单位未按中标通知书签订合同的问题时，招标单位应首先尝试通过沟通协商解决问题。若协商无果，则应及时采取法律手段维护自身权益。同时，招标单位也应加强与行政监督部门的沟通与合作，共同打击违法违规行为。在整个过程中，各方都应注重保留证据材料，以便在必要时提供证明并支持自己的主张。通过这些措施的实施，可以确保招标活动的顺利进行，并维护招标市场的公平、公正和透明。