结论前置：刑事案件中情节轻微的不起诉，并不意味着可以完全免除行政处罚。若行为同时违反了行政法规，行政机关仍有权依法追究其行政责任。
法律依据与解析
《中华人民共和国刑法》第三十七条：
- 该条款明确规定，对于犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以免予刑事处罚，但可以根据案件的不同情况，由主管部门予以行政处罚或者行政处分。这为行政机关在检察院不起诉后进行行政处罚提供了直接的法律基础。
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条及第一百七十九条：
- 这两条法律规定了检察院不起诉的情形及程序。当检察院决定不起诉时，应当将不起诉决定书送达公安机关，并可以提出检察意见，移送有关主管机关处理行政处罚等事宜。公安机关认为不起诉决定有误时，可要求复议或提请复核，但这不影响其对违法行为进行行政处罚的权力。
具体情形分析
法定不起诉：
- 当犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或存在如情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪等情形时，检察院会作出不起诉决定。但若行为本身违反了行政管理法规，行政机关仍有权依据相关行政法律规定对其追究行政责任。
酌定不起诉：
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的情况，检察院可以作出不起诉决定。然而，若该行为违反了行政管理秩序，行政机关仍可根据具体情况给予相应的行政处罚，如罚款、警告等。
证据不足不起诉：
- 当案件经过二次补充侦查后，检察院仍认为证据不足、不符合起诉条件时，会作出不起诉决定。这并不意味着被不起诉人的行为没有违法，只是现有证据无法达到刑事诉讼的证明标准。若有证据证明其行为违反了行政法律法规，行政机关可依法追究其行政责任。
实例说明
以涉嫌危险驾驶案件为例，若犯罪嫌疑人血液酒精含量刚达到醉酒标准且情节轻微，检察院可能作出不起诉决定。然而，该醉酒驾驶行为仍违反了《道路交通安全法》，因此公安机关可依法吊销其驾驶证或进行其他相应的行政处罚，如罚款、暂扣车辆等。
法律建议
- 积极配合调查：面对类似情况，建议行为人积极配合公安机关和检察院的调查取证工作，主动认罪悔过，以争取更好的法律结果。
- 了解行政处罚程序：若面临行政处罚，行为人应了解行政处罚的程序和要求，确保自己的合法权益得到保障。如有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
- 咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议行为人及其家属尽快向我咨询，以便获得准确的法律意见和帮助。我能够根据具体案情和相关法律规定，为行为人提供有效的法律辩护和策略建议。
综上所述，刑事案件中情节轻微的不起诉并不意味着可以完全免除行政处罚。若行为同时违反了行政法规，行政机关仍有权依法追究其行政责任。因此，行为人应积极配合调查取证工作，主动认罪悔过，并了解行政处罚的程序和要求，以维护自己的合法权益。