结论：两个员工上班打架，被打者还手的行为是否算严重违纪，不能一概而论，需结合公司规章制度、打架情节严重程度及造成的后果等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度层面
规章制度有明确规定：
- 若公司规章制度中明确规定，员工之间打架斗殴，无论主动攻击还是被动还手，均视为严重违反公司纪律，那么被打者还手的行为就可能被认定为严重违纪。这种情况下，公司有权依据规章制度对涉事员工进行相应的纪律处分，如警告、记过、降职降薪，甚至解除劳动合同等。
规章制度无明确规定或规定模糊：
- 若公司规章制度中未明确规定打架还手是否属于严重违纪，或者规定较为模糊，那么就需要结合实际情况，如打架的起因、过程、造成的后果等，以及公司的管理惯例和公平原则来进行判断。在这种情况下，公司不能仅凭员工还手就轻易认定其为严重违纪，而应进行全面、客观的调查，确保处理结果的公正性和合理性。
二、打架情节及后果层面
情节轻微，未造成严重后果：
- 如果打架情节轻微，双方只是互相推搡、拉扯，未造成人员受伤或财产损失等严重后果，那么被打者还手的行为可能不会被认定为严重违纪。公司可能会采取较为温和的处理方式，如口头警告、批评教育等，以促使员工认识到错误并改正。
情节严重，造成严重后果：
- 如果打架情节严重，如使用凶器、造成人员受伤或财产损失等严重后果，那么无论被打者是否还手，都可能被视为严重违反公司纪律和法律法规的行为。在这种情况下，公司不仅有权对涉事员工进行纪律处分，还可能涉及法律责任问题，如赔偿损失、承担刑事责任等。
三、法律建议
对于公司：
- 公司应制定明确、具体的规章制度，明确打架斗殴等违纪行为的认定标准和处理方式，以便在发生类似事件时能够迅速、公正地处理。
- 在处理打架事件时，公司应进行全面、客观的调查，确保处理结果的公正性和合理性。同时，公司还应加强对员工的法制教育和纪律教育，提高员工的法律意识和纪律意识。
对于员工：
- 员工应遵守公司的规章制度和法律法规，避免参与打架斗殴等违纪行为。如果遇到纠纷或冲突，应通过合理、合法的方式解决，如协商、调解、报警等。
- 如果员工因打架行为受到公司的纪律处分或法律责任追究，应积极配合公司的调查和处理工作，并寻求法律援助或咨询专业律师以维护自己的合法权益。
总结：两个员工上班打架，被打者还手的行为是否算严重违纪，需结合公司规章制度、打架情节严重程度及造成的后果等多方面因素综合判断。公司应制定明确的规章制度并加强法制教育和纪律教育；员工应遵守规章制度和法律法规，避免参与打架斗殴等违纪行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。