结论：当公司有经济犯罪时，员工是可以辞职的，但需要谨慎处理，以保障自身合法权益并避免卷入不必要的法律风险。以下是从不同角度为你详细分析的解答：
一、了解法律风险与责任边界
- 个人行为独立性：若你未直接参与公司的经济犯罪行为（如财务造假、挪用资金等），通常无需承担刑事责任。但你需要配合相关部门的调查，并保留好劳动合同、工资记录、工作邮件等文件，以证明自身与公司违法行为的隔离性。
- 避免书面承认参与犯罪：在调查期间，你有权保持沉默，拒绝签署任何可能涉及罪责的文件。如果被要求配合调查，你可以要求律师在场，以确保自己的合法权益不受侵害。
二、选择合规的离职方式
协商解除劳动合同：
- 适用场景：如果公司运营正常且愿意配合办理手续，你可以与HR或直属领导沟通离职意愿，明确最后工作日。
- 操作步骤：
- 要求签署《解除劳动合同协议书》，注明离职原因（如“个人发展”）、薪资结算日期及社保转移安排。
- 确认公司开具《离职证明》，以便后续求职或办理相关手续。
被迫解除劳动合同（需符合法定情形）：
- 适用条件：如果公司存在拖欠工资、未缴纳社保等违法行为，你可以依据《劳动合同法》第三十八条，书面通知公司后立即离职，并主张经济补偿金。
- 操作要点：
- 通过EMS邮寄《被迫解除劳动关系通知书》，并留存寄送凭证。
- 若公司拒绝支付补偿，你可以向劳动仲裁委申请仲裁，以维护自己的合法权益。
立即解除合同（极端情况）：
- 适用场景：如果公司被查封、负责人失联导致无法办理手续，你可以通过电子邮件或短信向公司声明离职。
- 应对措施：
- 向当地劳动监察大队备案离职事实，以便后续处理相关事宜。
- 后续通过法律途径追讨欠薪及证明材料，确保自己的权益不受损害。
三、关键注意事项
优先保障基础权益：
- 即使公司账户被冻结，你仍可尝试通过劳动仲裁主张欠薪。
- 申请失业保险需提供《离职证明》，若无法取得，可凭劳动合同、银行流水等证据向社保局说明情况。
防范次生风险：
- 警惕公司以“协助调查”为由拖延离职流程，确保自己的离职手续合法合规。
- 离职后避免使用原公司邮箱发送敏感信息，防止被认定为共犯或卷入不必要的法律纠纷。
四、特殊情境应对指南
公司进入破产清算程序：
- 你可以向破产管理人申报工资债权，优先于普通债务受偿，以确保自己的薪资得到保障。
高管或财务人员离职：
- 作为高管或财务人员，你需要额外审查是否存在签字审批的违规文件。
- 必要时聘请专业律师进行尽职调查，以确保自己的离职不会引发任何法律风险。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条：用人单位有下列情形之一的，劳动者可以解除劳动合同：（一）未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件的；（二）未及时足额支付劳动报酬的；（三）未依法为劳动者缴纳社会保险费的；（四）用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益的；（五）因本法第二十六条第一款规定的情形致使劳动合同无效的；（六）法律、行政法规规定劳动者可以解除劳动合同的其他情形。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条：劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（六）被依法追究刑事责任的。但此条款适用于员工犯罪时公司辞退员工的情形，与本题中员工辞职的情境相反，但可作为了解公司可能采取的措施的参考。
在处理公司经济犯罪背景下的离职问题时，建议你保持冷静、谨慎行事，并咨询专业律师（即我本人）的意见，以确保自己的合法权益得到充分保障。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。