结论：在伤残鉴定为二级且工伤保险已赔付的情况下，公司通常需承担停工留薪期工资福利、护理费（若工伤保险未全额覆盖）、一次性伤残就业补助金（在特定解除劳动合同情形下）以及可能存在的辅助器具配置费用差额等。以下为详细分析：

1. 停工留薪期工资福利

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
   • 公司责任：公司需按照职工原工资福利待遇标准，支付停工留薪期内的工资及福利，直至职工医疗终结或评定伤残等级后停止。对于二级伤残职工，停工留薪期一般较长，公司需承担相应费用。

2. 护理费（若工伤保险未全额覆盖）

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十四条，工伤职工已经评定伤残等级并经劳动能力鉴定委员会确认需要生活护理的，从工伤保险基金按月支付生活护理费。但若工伤保险基金支付的生活护理费低于职工实际需求或当地标准，公司可能需承担差额部分。
   • 公司责任：若工伤保险基金支付的生活护理费不足以满足职工实际需求，公司需根据职工实际情况和当地标准，承担差额部分的护理费。

3. 一次性伤残就业补助金（在特定解除劳动合同情形下）

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十六条，职工因工致残被鉴定为五级、六级伤残的，经工伤职工本人提出，该职工可以与用人单位解除或者终止劳动关系，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，由用人单位支付一次性伤残就业补助金。对于二级伤残职工，虽然通常不会主动提出解除劳动合同，但在某些特定情况下（如公司破产、解散等），可能涉及一次性伤残就业补助金的支付问题。不过，严格来说，二级伤残职工更可能享受长期待遇而非一次性补助，但此处为全面分析，仍提及此可能性。
   • 公司责任：在特定解除劳动合同情形下，公司需按照当地规定支付一次性伤残就业补助金。但需注意，二级伤残职工通常更倾向于保留劳动关系以享受长期待遇，因此此情形相对较少见。

4. 辅助器具配置费用差额

   • 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十二条，工伤职工因日常生活或者就业需要，经劳动能力鉴定委员会确认，可以安装假肢、矫形器、假眼、假牙和配置轮椅等辅助器具，所需费用按照国家规定的标准从工伤保险基金支付。但若实际配置费用高于工伤保险基金支付标准，公司可能需承担差额部分。
   • 公司责任：若职工实际配置的辅助器具费用高于工伤保险基金支付标准，且该差额部分未通过其他途径（如商业保险等）得到补偿，公司可能需根据职工实际情况和当地规定，承担差额部分的费用。不过，这种情况相对较少见，且通常需通过协商或法律途径确定责任承担。

特别说明：对于二级伤残职工，其工伤保险待遇通常较为优厚，包括长期伤残津贴、生活护理费等。公司需严格遵守相关法律法规，确保职工权益得到充分保障。若公司在工伤保险赔付后仍需承担额外费用，应积极与职工协商解决，避免法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。