复印件标明“只供员工档案使用”这一行为本身并不直接涉及违法性判断，但其合法性需结合具体使用场景、目的及是否侵犯他人权益来综合考量。以下从不同角度为你详细分析：

一、从档案管理的合规性角度

在员工档案管理中，企业为了规范管理、保护员工隐私及确保档案信息的准确性，常常会对档案材料的复制、使用等环节进行严格规定。标明“只供员工档案使用”的复印件，若确实仅用于员工档案的整理、归档、查阅等内部管理活动，且未泄露给无关第三方或用于其他非法目的，那么这种行为通常是合法的。它体现了企业对档案管理的严谨态度，有助于维护档案的完整性和安全性。

二、从隐私权保护的角度

员工档案中往往包含大量个人隐私信息，如身份证号码、家庭住址、联系方式、健康状况等。企业在处理这些信息时，必须严格遵守相关法律法规，确保员工的隐私权不受侵犯。若复印件的标注和使用严格限制在员工档案管理的范围内，且企业采取了必要的安全措施（如加密存储、限制查阅权限等），那么这种行为是符合隐私权保护要求的。反之，若企业将标注有“只供员工档案使用”的复印件泄露给外部机构或个人，或用于其他非法目的，则可能构成对员工隐私权的侵犯，需要承担相应的法律责任。

三、从合同或规章制度的角度

企业在制定员工手册、劳动合同或相关规章制度时，可能会对员工档案的复制、使用等事项作出明确规定。若这些规定中明确允许或限制了复印件的使用范围，并得到了员工的同意或认可，那么企业按照这些规定使用复印件的行为就是合法的。但需要注意的是，企业的规章制度必须符合法律法规的要求，不得侵犯员工的合法权益。若规章制度中的相关规定与法律法规相抵触，则这些规定是无效的，企业不能依据它们来主张自己的行为合法。

四、从实际操作中的注意事项角度

1. 明确标注目的：在复印件上标注“只供员工档案使用”时，应明确标注的目的和范围，避免产生歧义或误解。
2. 加强安全管理：企业应采取必要的安全措施，确保复印件不被泄露或滥用。例如，可以设置查阅权限、加密存储等。
3. 遵守法律法规：企业在处理员工档案信息时，必须严格遵守相关法律法规的要求，不得侵犯员工的合法权益。
4. 及时更新档案：对于已经失效或不再需要的复印件，企业应及时进行销毁或处理，避免造成不必要的法律风险。

总结来说，复印件标明“只供员工档案使用”这一行为本身并不直接涉及违法性判断，但其合法性需结合具体使用场景、目的及是否侵犯他人权益来综合考量。若你在实际操作中遇到相关问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。