事业单位两名工作人员在单位打架，单位可根据情节轻重，分别给予两人相应的处理，具体如下：

1. 内部纪律处分：

   • 依据：事业单位通常有内部规章制度，对员工的行为规范有明确要求。打架行为往往违反了单位的纪律规定，如《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关规定。
   • 处理方式：单位可根据规章制度，对打架的双方给予警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除等处分。具体处分种类和幅度，需根据打架的情节、后果以及单位的规定来确定。

2. 调解与和解：

   • 依据：在打架事件发生后，单位可以组织双方进行调解，尝试通过沟通协商解决纠纷。
   • 处理方式：如果双方愿意和解，并达成和解协议，单位可以依据和解协议的内容，对双方进行相应的处理，如减轻或免除处分。调解过程中，单位应确保调解的公正性和合法性，保护双方的合法权益。

3. 报警处理：

   • 依据：如果打架行为造成了人身伤害或财产损失，且情节严重，可能构成治安违法或刑事犯罪。
   • 处理方式：单位应及时报警，由公安机关依法处理。公安机关会根据打架的情节和后果，对打架的双方进行治安处罚或刑事追究。同时，单位可以根据公安机关的处理结果，对打架的双方进行相应的纪律处分。

4. 法律责任追究：

   • 依据：如果打架行为造成了严重的后果，如重伤、死亡或重大财产损失，可能构成刑事犯罪。
   • 处理方式：在这种情况下，除了单位内部的纪律处分和公安机关的治安处罚外，打架的双方还可能面临刑事责任的追究。单位应积极配合司法机关的调查和处理工作，确保案件的公正处理。