员工因工作原因在单位打架，这是一个比较严重的问题，需要根据具体情况进行妥善处理。以下是一些建议的处理步骤和注意事项：
首先，单位应立即制止打架行为，并确保现场安全，防止事态进一步恶化。同时，应尽快了解事情的来龙去脉，包括打架的起因、参与人员、伤亡情况等。
接下来，根据打架的具体情况，单位可以采取以下不同的处理措施：
如果打架行为是因履行工作职责而引发的：
- 员工在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害，可以申请工伤认定。在认定为工伤后，员工可以同时主张工伤赔偿和人身损害赔偿。
- 单位应关注受伤员工的身体状况，提供必要的医疗救助和康复支持。
如果打架行为未犯罪但违反了《治安管理处罚法》：
- 对于严重违反用人单位规章制度的打架行为，单位可以单方面解除劳动合同。但在此之前，应确保规章制度中已有开除打架员工的相关规定，并且该规定已提前告知劳动者。
- 单位在解除劳动合同时，应出具解除劳动合同通知书，并明确解除的原因和依据。
如果打架行为构成了犯罪：
- 如员工犯故意伤害罪、故意杀人罪等，应依法承担刑事责任。在此情况下，单位可以单方面解除劳动合同，且无需支付经济补偿金或赔偿金。
- 单位应配合司法机关的调查和处理工作，提供必要的证据和信息。
在处理过程中，单位还应注意以下几点：
- 保持公正和客观：单位在处理打架事件时，应秉持公正和客观的态度，不偏袒任何一方，确保处理结果的公平性和合理性。
- 加强员工教育和培训：单位应加强对员工的教育和培训，提高员工的法律意识和职业素养，预防类似事件的再次发生。
- 完善规章制度：单位应完善相关规章制度，明确打架等违纪行为的处理办法和程序，为员工提供一个清晰、规范的工作环境。
总之，员工因工作原因在单位打架是一个需要认真对待的问题。单位应根据具体情况采取合适的处理措施，并确保处理过程的公正、合法和有效。同时，也应加强员工教育和培训，完善规章制度，预防类似事件的再次发生。