行政单位加班没调休完年底清零是否合法，需分情况讨论：
若行政单位有明确的规章制度规定加班调休及清零机制，且该制度不违反法律法规的强制性规定：
- 在这种情况下，如果行政单位已经按照其规章制度，对加班调休进行了合理安排，并在年底对未调休完的加班时间进行清零，且这一做法在制度中有明确规定，同时该制度本身不违反国家关于加班、调休及劳动报酬的相关法律法规，那么这种做法可能是合法的。但需要注意的是，即便制度有规定，也需确保员工的知情权，即员工在入职时或制度变更时，已经明确知晓并同意了这一规定。
若行政单位没有明确的规章制度，或规章制度违反法律法规的强制性规定：
- 无制度或制度违法时，清零做法不合法：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者因工作需要加班的，用人单位应当安排补休或支付加班费。如果行政单位没有明确的规章制度来规范加班调休及清零问题，或者其规章制度违反了法律法规的强制性规定（如规定加班必须无偿清零，不支付加班费也不安排补休），那么这种年底清零的做法就是不合法的。
- 员工有权要求补休或加班费：在这种情况下，员工有权要求行政单位按照法律法规的规定，安排补休或支付加班费。如果行政单位拒绝履行这一义务，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
法律背景与建议：
- 法律背景：加班调休及加班费支付是劳动法中的重要内容，旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动者在付出额外劳动后能够得到相应的补偿或休息。行政单位作为用人单位，同样需要遵守这些规定。
- 建议：对于行政单位而言，应当建立完善的加班调休制度，明确加班调休的流程、时限及清零机制（如有），并确保这一制度符合法律法规的强制性规定。同时，行政单位还应当加强员工的法律培训，提高员工的法律意识，确保员工在入职时或制度变更时能够明确知晓并同意相关规定。对于员工而言，如果遇到加班调休及清零问题，应当及时与行政单位沟通协商，如果协商无果，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果行政单位违反法律法规关于加班调休及加班费支付的规定，可能会面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，行政单位还可能需要承担因违法而给员工造成的损失赔偿责任。
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