公司规定加班调休两个月清零，这一做法通常是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者在加班后有权获得相应的补偿，这种补偿可以是支付加班费，也可以是安排调休。调休是劳动者加班后的一种合法权利，公司应当尊重并保障这一权利的实现。
公司规定的合法性分析
调休权利的保障：
- 劳动者加班后，公司应当根据实际情况安排调休，以保障劳动者的休息权。如果公司单方面规定加班调休两个月清零，这实际上剥夺了劳动者在一定期限内行使调休权利的机会，违反了劳动法的相关规定。
公司规章制度的合法性：
- 公司的规章制度应当符合法律法规的规定，不得侵犯劳动者的合法权益。如果公司的规章制度与法律法规相抵触，那么该规章制度是无效的。因此，公司规定加班调休两个月清零，如果违反了劳动法的相关规定，那么这一规定是无效的。
劳动合同与集体合同的约定：
- 如果劳动合同或集体合同中明确规定了加班调休的相关条款，那么公司应当遵守这些约定。如果公司违反了劳动合同或集体合同的约定，劳动者有权要求公司承担相应的法律责任。
可能的法律后果
劳动者维权：
- 如果公司规定加班调休两个月清零，劳动者可以向劳动监察部门投诉，要求公司纠正这一违法行为。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求公司改正违法行为。
公司承担法律责任：
- 如果公司违反了劳动法的相关规定，侵犯了劳动者的合法权益，那么公司可能需要承担相应的法律责任，包括支付加班费、赔偿损失等。
建议与措施
与公司协商：
- 如果劳动者发现公司存在加班调休两个月清零的规定，可以先与公司进行协商，要求公司改正这一违法行为，并保障劳动者的调休权利。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，劳动者可以寻求法律援助，向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
保留证据：
- 劳动者在维权过程中，应当注意保留相关证据，如加班记录、调休记录、公司规章制度等，以便在仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。
综上所述，公司规定加班调休两个月清零通常是不合法的。劳动者在面对这种情况时，应当了解自己的合法权益，并采取相应的措施来维护自己的权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。