关于您提出的“调休年底清零是否合法”的问题，这主要涉及到的是年休假（调休的一种形式，这里我们主要讨论年休假的情况，因为调休的具体规定可能因公司政策而异，但年休假有明确的法律规定）的安排和补偿问题。

首先，我们需要明确的是，年休假是法律赋予劳动者的休息权利，其目的在于维护劳动者的身心健康和工作效率。根据《职工带薪年休假条例》的相关规定，年休假一般应在1个年度内安排，但单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。这意味着，年休假并不一定要在当前年度休完，用人单位有权根据工作需要和职工意愿进行跨年度安排。

然而，如果用人单位确实因工作原因无法安排劳动者休年休假的，对劳动者应休未休的年休假天数，应当按照法律规定计发支付工资。具体来说，就是按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。这一规定确保了劳动者在无法享受年休假时，能够得到相应的经济补偿。

现在，我们回到您的问题上。如果用人单位将调休（或年休假）安排在年底，并且明确告知了劳动者，且这种安排符合公司的生产、工作需要和职工的意愿，那么这种安排是合法的。但是，如果用人单位未经劳动者同意，单方面将调休（或年休假）年底清零，且未按照法律规定支付相应的经济补偿，那么这种做法就是不合法的。

以您可能遇到的实际情况为例，如果公司在年底时未经您同意就清零了您的调休（或年休假），并且没有支付相应的工资报酬，那么您有权向公司提出异议，并要求公司按照法律规定进行补偿。如果公司拒绝补偿，您还可以向劳动仲裁机构或法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，调休（或年休假）年底清零是否合法，关键在于用人单位是否按照法律规定进行了安排和补偿。如果用人单位未经劳动者同意就清零调休（或年休假），且未支付相应工资报酬，那么这种做法就是不合法的。