核心结论：当农民工工资超过进度款比例时，可从合同约定、法律规定、协商解决、法律救济等角度来处理，具体如下：

1. 合同约定角度
   • 首先查看农民工与用工方签订的劳动合同或者相关协议中，对于工资支付比例、进度款支付等事项是否有明确约定。如果合同中有相关规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照合同约定履行。例如，合同中约定工资支付比例可以超过进度款比例，用工方就应按照约定支付工资。
   • 若合同约定不明确或者没有相关约定，就需要进一步依据其他规定来处理。
2. 法律规定角度
   • 根据《保障农民工工资支付条例》等相关法律法规，农民工有按时足额获得工资的权利。用工方不得以工程进度款未到位等理由克扣或者拖欠农民工工资。所以，即使工资超过进度款比例，用工方也不能以此为由拒绝支付农民工工资。
   • 如果用工方确实存在资金困难，无法按时支付工资，应当按照规定向人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门报告，并按照要求制定工资支付计划。同时，用工方还可以与农民工协商，在合理期限内分期支付工资，但必须保障农民工的基本生活需求。
3. 协商解决角度
   • 农民工可以与用工方进行友好协商，说明自己的工资诉求和实际情况。用工方也可以向农民工解释工程进度款的情况以及目前面临的困难。通过协商，双方可以达成一个双方都能接受的解决方案，例如调整工资支付时间、分期支付等。
   • 在协商过程中，双方应当保持理性和冷静，以解决问题为目的，避免矛盾激化。同时，建议将协商的结果以书面形式记录下来，双方签字确认，以防止后续出现纠纷。
4. 法律救济角度
   • 如果协商无果，农民工可以向当地劳动保障监察机构投诉举报。劳动保障监察机构会依法对用工方的违法行为进行调查处理，责令用工方限期支付工资。
   • 农民工也可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。在申请仲裁时，农民工需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己的工资诉求。
   • 如果对仲裁结果不服，农民工还可以向人民法院提起诉讼。法院会根据事实和法律规定，作出公正的判决。