中标单位不缴纳代理费用，招标代理单位不可以直接不发中标通知书，但可以采取其他合法措施来维护自身权益。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律层面分析
中标通知书的发放义务：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标人在确定中标人后，应当向中标人发出中标通知书。这是招标人的法定义务，旨在确认中标结果并通知中标人准备签订合同。
- 中标通知书的发放与中标单位是否缴纳代理费用无直接关联。招标代理单位作为招标人的代理人，其职责是协助招标人完成招标流程，包括发出中标通知书，但无权因代理费用问题而拒绝发放。
代理费用的支付问题：
- 代理费用的支付通常会在招标代理合同中明确约定。当中标单位不支付代理费时，招标代理机构应依据合同约定和法律规定来维护自身权益，而非直接拒绝发放中标通知书。
- 《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的规定也适用于此情况，即当事人应当按照约定全面履行自己的义务。中标单位不支付代理费，构成违约，招标代理机构有权要求其承担违约责任。
二、实际操作建议
友好协商：
- 首先，招标代理机构可以尝试与中标单位进行友好协商，了解其不支付代理费的原因，并寻求双方都能接受的解决方案，如延期支付、分期支付等。
正式催告：
- 若协商无果，招标代理机构可以向中标单位发出正式的催告函，要求其按照合同约定支付代理费。催告函中应明确支付期限、逾期支付的后果等，以给中标单位施加一定的压力。
法律途径解决：
- 若中标单位在催告后仍未支付代理费，招标代理机构有权向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求中标单位支付代理费及可能产生的违约金、利息等。
- 在诉讼过程中，招标代理机构需提供充分的证据证明中标单位未履行合同约定的支付义务，如招标代理合同、催告函、中标单位未支付的记录等。
其他辅助措施：
- 根据合同约定，若中标单位长期拖欠代理费，招标代理机构可考虑暂停提供后续服务或解除合同。但这一措施需谨慎使用，以免引发更大的纠纷。
- 招标代理机构还可以将中标单位的不诚信行为通报给相关行业组织或监管部门，影响其市场声誉和信用记录，以促使中标单位重视合同履行。
三、可能面临的法律后果
- 若招标代理机构因中标单位不支付代理费而拒绝发放中标通知书，可能构成违约或违法行为，需承担相应的法律责任，如赔偿中标单位因此遭受的损失等。
- 相反，若招标代理机构通过合法途径维护自身权益，如提起诉讼并获得法院支持，则中标单位需承担支付代理费及可能产生的其他费用的法律责任。
综上所述，中标单位不缴纳代理费用时，招标代理单位应通过合法途径来维护自身权益，而非直接拒绝发放中标通知书。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。