关于单位让员工签保证书是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况、保证书的内容以及签订过程是否遵循了相关法律法规来综合判断。
首先，我们要明确的是，签订保证书属于民事活动，应当遵循平等、自愿、公平、诚实信用的原则。这意味着，保证书的签订必须是双方平等协商、自愿达成的，且内容要公平合理，不能违反法律法规的强制性规定。
一、合法情形
如果保证书的内容是员工自愿承担的、与工作相关的合理责任，且签订过程没有受到任何胁迫或欺诈，那么这样的保证书在法律上可能是有效的。例如，员工自愿承诺在离职后遵守竞业限制协议，不泄露公司商业秘密等，这样的保证书在符合相关法律规定的情况下，是具有法律效力的。
二、非法情形
然而，如果保证书的内容违反了法律法规的强制性规定，或者签订过程存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，那么这样的保证书就是无效的。具体来说：
内容违法：如果保证书要求员工承担的法律责任超出了其应当承担的范围，或者违反了劳动法、民法典等相关法律法规的规定，那么这样的保证书是无效的。例如，要求员工为公司业务承担无限连带责任，或者放弃员工应享有的合法权益等。
签订过程不合法：如果员工是在受到胁迫、欺诈或者乘人之危的情况下签订的保证书，那么这样的保证书也是无效的。例如，在员工申请工伤认定时，公司利用优势地位强迫员工签订放弃工伤保险待遇的保证书，这样的保证书就属于乘人之危，是无效的。
三、实际案例参考
从您提供的两个案例中，我们可以看到：
在第一个案例中，小马虽然签署了《承诺书》，但法院认为其签订时并非平等民事主体关系，且签字不能认定具有担保的真实意思表示，因此判决小马无需承担连带清偿责任。这说明，如果保证书的签订过程不符合法律规定，即使员工签署了，也可能不具有法律效力。
在第二个案例中，孙某在申请工伤认定时被公司强迫签订了不公平的《承诺保证书》，法院判决该保证书无效，并要求公司向孙某支付应得的工伤保险待遇。这进一步说明了，如果保证书的内容违反了法律法规的强制性规定，或者签订过程存在欺诈、胁迫等情形，那么这样的保证书是无效的。
四、建议
对于员工来说，如果单位要求签订保证书，应当仔细阅读保证书的内容，确保自己能够承担其中的责任，并且签订过程要遵循平等、自愿、公平的原则。如果认为保证书的内容不合理或者签订过程存在不合法情形，可以拒绝签署，并向相关部门寻求帮助。
对于单位来说，应当尊重员工的合法权益，避免要求员工签订违法或者不合理的保证书。如果确实需要员工承担一定的责任，应当通过合法、合理的方式与员工进行协商，并确保保证书的内容符合法律法规的规定。
综上所述，单位让员工签保证书是否合法，需要根据具体情况、保证书的内容以及签订过程是否遵循了相关法律法规来综合判断。