结论：公司违法离职3个月后，是否还有关系取决于具体的情况和后续的法律行动。一般来说，如果劳动者认为公司违法离职，即使已经过去3个月，仍然可以通过法律途径来维护自己的权益，与公司的关系在法律层面上可能并未完全终结。
分析说明：
违法离职的认定：
- 违法离职通常指的是公司未按照法定程序或劳动合同约定，单方面解除与劳动者的劳动关系。这可能包括未提前通知、未支付经济补偿、未出具离职证明等违法行为。
法律时效性：
- 对于违法离职的争议，劳动者通常需要在一定的时效期内（如劳动争议仲裁时效，一般为一年，具体根据当地法律法规确定）提出仲裁或诉讼，以维护自己的权益。虽然3个月已经过去，但只要仍在时效期内，劳动者仍然可以采取法律行动。
- 即使超过了某些特定的时效期（如某些地区的劳动监察投诉时效可能较短），劳动者仍然可以尝试通过协商、调解或诉讼等方式来寻求解决方案，尤其是当公司存在明显违法行为时。
后续法律行动：
- 劳动者可以收集相关证据（如劳动合同、工资单、离职通知、公司违法行为的相关证据等），向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司承担违法离职的法律责任，如支付经济补偿、赔偿金等。
- 如果对仲裁结果不满，劳动者还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
与公司的关系：
- 从法律角度来看，即使公司已经违法离职，且劳动者已经离开公司3个月，但只要劳动者未放弃追究公司法律责任的权利，且仍在法律时效期内，那么劳动者与公司之间的法律关系（至少是在违法离职这一争议上）并未完全终结。
- 此外，如果公司未出具离职证明或未办理相关手续，这也可能影响劳动者与新雇主之间的劳动关系建立，从而间接影响劳动者与原公司的关系。
行动建议：
- 收集证据：尽快收集与公司违法离职相关的所有证据，包括但不限于劳动合同、工资单、离职通知、公司违法行为的相关证据等。
- 咨询专业律师：由于劳动法律问题具有复杂性和地域性，建议咨询当地的专业律师，以获取更具体和准确的法律建议。
- 采取法律行动：如果认为公司确实存在违法离职行为，且仍在法律时效期内，可以考虑向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
特殊场景：
- 如果劳动者已经与公司达成了某种和解或协议，且该协议已经履行完毕，那么劳动者与公司之间的法律关系可能已经终结。但在此情况下，如果劳动者发现公司存在欺诈、胁迫等违法行为，仍然可以寻求法律救济。
- 如果劳动者在离职后已经找到了新的工作，且新雇主对劳动者的离职证明或相关手续没有特殊要求，那么劳动者与公司之间的法律关系（至少是在日常工作中）可能已经相对独立。但这并不影响劳动者追究公司违法离职的法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。