核心结论：农民工工资卡被包工头持有属于违法行为，农民工有权要求返还工资卡并自行保管，若包工头拒不归还或存在其他违法行为，可通过法律途径维权。以下是具体分析：

1. 工资卡的所有权与保管权归属
   根据《劳动法》及《保障农民工工资支付条例》，工资卡是农民工个人财产，其所有权、保管权及支配权均归农民工本人所有。包工头无权以任何理由（如“代管”“统一发放”等）扣留或控制工资卡，此行为已涉嫌侵犯农民工财产权。

2. 包工头行为的法律定性
   若包工头通过持有工资卡实际控制农民工工资（如私自取款、截留工资），可能构成以下违法行为：

   • 侵占罪：若以非法占有为目的，将农民工工资据为己有且数额较大，可能触犯《刑法》第270条；
     
   • 拒不支付劳动报酬罪：若包工头为用工主体（如实际承包人），以转移财产、逃匿等方法逃避支付工资，数额较大且经政府有关部门责令支付仍不支付的，可能触犯《刑法》第276条之一；
     
   • 违反《保障农民工工资支付条例》：即使不构成犯罪，包工头的行为也违反了该条例第31条“工资应当直接发放给农民工本人”的规定，可由劳动保障监察部门责令改正，并处以罚款。

3. 农民工的维权路径

   • 第一步：协商与取证
     要求包工头立即返还工资卡，并保留书面或录音证据（如微信聊天记录、通话录音）。若包工头以“代管”为由拒绝，可明确告知其行为违法，并要求书面说明工资发放方式（如转账至工资卡、现金领取等）。
     
   • 第二步：向相关部门投诉
     若协商无果，可向当地劳动保障监察大队投诉（拨打12333或通过国务院根治欠薪平台反映），要求调查包工头是否存在拖欠工资、扣留工资卡等违法行为。
     
   • 第三步：申请劳动仲裁或起诉
     若包工头为用工主体（如实际承包人），可申请劳动仲裁要求支付工资及赔偿；若包工头仅为中间人，可起诉其侵犯财产权，要求返还工资卡并赔偿损失（如因无法及时取款导致的利息损失）。
     

4. 特殊情形处理

   • 工资卡被用于非法用途：若发现工资卡被用于洗钱、诈骗等犯罪活动，应立即报警并挂失卡片，避免自身卷入法律风险。
     
   • 包工头失联或拒不露面：可向法院申请支付令或直接起诉，通过法律程序冻结其财产（如工程款、保证金等）以保障工资支付。
     

温馨提示：农民工在维权过程中需注意保留证据（如工资条、考勤记录、工作证等），以证明劳动关系及工资被拖欠的事实。若遇到复杂情况，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细法律方案。