结论：能否起诉需分情况讨论，关键在于合同约定、实际履行情况及是否存在违约事实，以下为具体分析：

1. 合同明确约定税率且对方构成根本违约
   若双方签订的合同中明确约定“乙方应开具税率为9%的增值税专用发票”，且该条款属于合同核心义务（例如合同价款已按9%税率计算，或甲方明确要求用于进项抵扣），而乙方仅开具1%税率发票导致甲方无法实现合同目的（如无法足额抵扣税款、面临税务风险或经济损失），则甲方有权以“违约”为由起诉。此时需重点审查：

   • 合同是否将开票条款与付款、违约责任等挂钩（例如约定“未按约定开票，甲方有权拒付尾款或要求赔偿损失”）；
     
   • 甲方是否已因乙方行为产生实际损失（如多缴纳的税款、税务机关处罚等）；
     
   • 乙方是否存在主观过错（如故意低开以少缴税款，或明知无法开票仍承诺）。
     

2. 合同未明确约定税率或开票非核心义务
   若合同仅笼统约定“乙方应提供合法发票”，未明确税率，或开票义务属于附随义务（例如合同主要目的是货物交付/服务提供，开票仅为辅助义务），则乙方开具1%发票可能不构成根本违约。此时甲方起诉可能面临以下风险：

   • 法院可能认为“税率差异未影响合同主要目的”，驳回甲方关于解除合同或高额赔偿的请求；
     
   • 若甲方主张“损失”，需证明实际损失与乙方开票行为存在直接因果关系（例如税务机关明确要求补税），否则可能仅支持部分赔偿。
     

3. 税务合规性对诉讼的影响
   需注意：若乙方开具1%发票的行为本身违反税务法规（例如虚构交易、虚开发票），则甲方可能面临“接受虚开发票”的税务风险（如进项转出、罚款）。此时甲方应优先向税务机关举报，而非直接起诉，否则可能因自身违法导致诉求不被支持。

建议行动步骤：

1. 立即审查合同条款，确认开票税率、违约责任等约定；
   
2. 收集乙方未按约定开票的证据（如聊天记录、邮件、发票复印件）；
   
3. 评估自身损失（如多缴税款、合同履行障碍等）；
   
4. 若损失明确且乙方拒绝协商，可向法院起诉，诉求包括：要求重新开票、赔偿损失、支付违约金（如有约定）；
   
5. 若涉及税务违法，同步向税务机关举报，降低自身风险。
   

如有进一步细节（如合同具体条款、损失计算方式等），可直接向我咨询，我会结合证据为您制定具体方案。