结论：农民工年龄超过50岁，用人单位将工资打入农民工子女卡上的行为，是否违法需根据具体情况来判断，但一般而言，未经农民工本人同意擅自更改工资发放账户可能涉及违法。以下是对此问题的详细分析：
一、可能涉及的法律问题
侵犯劳动者权益：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有权获得劳动报酬，且报酬应当以货币形式按月支付给劳动者本人。用人单位未经劳动者同意，擅自更改工资发放账户，可能侵犯了劳动者的这一基本权益。
违反劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了工资发放的方式和账户，用人单位擅自更改可能构成违约行为。劳动者有权要求用人单位按照合同约定履行义务。
潜在的税务和财务问题：
- 工资发放账户的更改可能涉及税务和财务方面的合规性问题。如果用人单位未能妥善处理相关税务和财务手续，可能面临税务处罚或财务违规的风险。
二、具体情境分析
农民工同意的情况：
- 如果农民工本人同意将工资打入子女卡上，并且这一行为不违反劳动合同的约定和相关法律法规，那么这种行为是合法的。但在此情况下，建议农民工与用人单位签订书面协议，明确工资发放账户的变更事宜，以避免后续纠纷。
农民工不同意的情况：
- 如果农民工本人不同意将工资打入子女卡上，用人单位擅自更改则可能构成违法。农民工有权要求用人单位恢复原工资发放账户，并可能因此向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
三、法律建议
与用人单位沟通：
- 如果农民工发现工资发放账户被擅自更改，首先应与用人单位进行沟通，了解更改的原因和背景，并表达自己的意愿和诉求。
保留证据：
- 农民工应保留与工资发放相关的所有证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以便在需要时证明自己的权益。
寻求法律援助：
- 如果与用人单位沟通无果，农民工可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，寻求法律援助和保护。在此过程中，农民工可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
四、可能的法律后果
用人单位被责令改正：
- 如果用人单位擅自更改工资发放账户的行为被认定为违法，劳动监察部门可能责令其改正，并恢复原工资发放账户。
用人单位面临处罚：
- 在严重情况下，用人单位可能因违反劳动法律法规而面临罚款、赔偿等处罚。
劳动者获得赔偿：
- 如果农民工因用人单位擅自更改工资发放账户而遭受损失，如无法及时领取工资、产生额外费用等，有权要求用人单位进行赔偿。
综上所述，农民工年龄超过50岁，用人单位将工资打入农民工子女卡上的行为是否违法需根据具体情况来判断。如果农民工本人不同意且用人单位擅自更改，则可能构成违法。在此情况下，农民工应与用人单位沟通、保留证据并寻求法律援助以保护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。