结论概述：在基本农田上建厂房并领取国家粮补的行为，属于违法违规行为，相关建筑物可能会面临拆除，并且相关责任人还可能面临其他法律责任。不过，具体是否一定会拆除，还需根据违法情节的严重程度、当地政府的执法力度以及是否及时整改等多种因素来综合判断。
详细分析：
基本农田的保护规定：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》和《基本农田保护条例》的相关规定，基本农田是受到严格保护的，任何单位和个人不得擅自改变其用途，不得在基本农田上从事非农业建设活动，如建厂房等。
违法行为的后果：
- 在基本农田上建厂房，违反了土地管理法规，属于违法行为。对于此类违法行为，县级以上人民政府土地行政主管部门有权责令限期改正或者治理，恢复原种植条件，并可能处以罚款。
- 如果违法情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。
关于拆除的可能性：
- 拆除的法律依据：根据相关法律法规，对于在基本农田上非法建设的建筑物，政府有权责令拆除，以恢复土地原状。
- 拆除的实际情况：是否拆除以及拆除的时间、方式等，通常取决于违法情节的严重程度、当地政府的执法力度以及是否及时整改等因素。如果违法情节较轻，且能够及时整改，可能不会立即拆除；但如果违法情节严重，且拒不整改，则拆除的可能性较大。
领取粮补的违法性：
- 粮补是国家为了鼓励农民种植粮食而给予的补贴，其发放对象应为实际种植粮食的农民。如果在基本农田上建厂房并领取粮补，不仅违反了土地管理法规，还涉嫌骗取国家补贴，属于违法行为。
法律建议：
- 立即停止违法行为：如果已经在基本农田上建了厂房，应立即停止使用，并考虑拆除或整改，以符合土地管理法规的要求。
- 主动配合政府调查：如果政府已经介入调查，应主动配合，如实说明情况，并积极整改，以减轻可能的法律责任。
- 咨询专业律师：对于此类复杂的法律问题，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
可能的其他法律后果：
- 除了面临拆除和罚款外，相关责任人还可能因骗取国家补贴而面临刑事责任，如诈骗罪等。
- 如果因违法行为导致土地资源破坏或环境污染等后果，还可能面临环境修复责任等。
总之，在基本农田上建厂房并领取国家粮补的行为是违法违规的，相关建筑物可能会面临拆除，并且相关责任人还可能面临其他法律责任。因此，建议严格遵守土地管理法规，不要在基本农田上从事非农业建设活动。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。