将公司以返还社保补贴协议写进合同是否合法需分情况讨论，具体如下：
- 若社保补贴协议内容符合法律法规，且不损害劳动者权益，则合法
根据《劳动合同法》第十七条，劳动合同可约定劳动报酬、社会保险等条款。若公司以返还社保补贴形式替代法定社保缴纳义务（如要求员工书面承诺放弃社保，公司以补贴形式补偿），则该协议因违反《社会保险法》强制性规定而无效。但若公司已依法为员工缴纳社保，额外提供补贴作为福利，并约定员工离职时需返还部分补贴（如未满服务期），则该约定可能被认定为合法，但需满足以下条件：
- 补贴性质为福利而非社保替代；
- 返还条件合理（如服务期约定未显失公平）；
- 不违反《劳动合同法》第二十五条关于违约金限制的规定（仅培训服务期、竞业限制可约定违约金）。
- 若协议以规避社保缴纳为目的，则违法且无效
根据《社会保险法》第五十八条，用人单位必须自用工之日起30日内为员工办理社保登记。若公司通过协议要求员工放弃社保，以补贴形式替代，该行为涉嫌逃避法定义务，可能面临以下法律后果：
- 劳动行政部门责令补缴社保并加收滞纳金（《社会保险法》第八十六条）；
- 员工可依据《劳动合同法》第三十八条主张被迫解除劳动合同，并要求经济补偿；
- 协议因违反法律强制性规定被认定无效（《民法典》第一百五十三条）。
实务建议：
- 对公司而言，应避免将社保补贴与社保缴纳义务挂钩，可将补贴作为独立福利条款约定；
- 对劳动者而言，若发现公司以补贴替代社保，可向当地社保部门投诉或申请劳动仲裁；
- 双方若需约定服务期返还补贴，应明确补贴性质、返还条件及比例，避免约定违法违约金。
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