关于您提出的“社保部分补贴协议写在工资里面是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法和社会保险法规的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、核心结论
工资里是否包含社保补贴，其合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况和合同条款来综合判断。在大多数情况下，用人单位应依法为劳动者缴纳社保费，而不能简单地以社保补贴来替代。但在某些特定且符合法律法规的情境下，工资中包含社保补贴的做法可能被视为合法。
二、法律规定与原则解析
法定义务不可规避：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第七十二条和《社会保险费征缴暂行条例》第十二条，用人单位和劳动者都有依法参加社会保险、缴纳社会保险费的法定义务。这一义务是强制性的，不能通过双方的约定或其他方式来规避。
合同约定的边界：
- 如果劳动合同或相关协议中明确写明了工资包含社保补贴，并且补贴数额也清晰明确，这种做法在形式上可能看似具有合法性。但关键在于，这种约定必须严格遵守法律法规的强制性规定，不能损害劳动者的合法权益。
三、潜在风险与问题
劳动者权益受损：
- 社保补贴无法完全替代实际的社会保险。如果劳动者未实际缴纳社保，在面临生病、失业、工伤、生育等风险时，将无法享受相应的社会保险待遇，这可能会给劳动者带来沉重的经济负担。
- 养老保险的缺失还会影响劳动者的退休生活质量，这是无法用金钱来衡量的。
用人单位法律风险：
- 如果用人单位未依法缴纳社保，可能会面临劳动保障行政部门的查处和高额罚款。
- 劳动者也有权通过劳动仲裁、诉讼等方式要求用人单位补缴社保费用，用人单位需承担相应的法律后果。
最低工资标准考量：
- 即使合同中约定了社保补贴，也应确保劳动者的实际收入不低于当地的最低工资标准。这是保障劳动者基本生活的重要措施。
四、特殊情况与合理性探讨
- 在某些特定情况下，如退休返聘人员已依法享受社会保险待遇，或非全日制用工中双方协商一致不缴纳社保而给予一定补贴等，工资中包含社保补贴的做法可能具有一定的合理性。但这些情况必须严格遵守相关法律法规，并明确双方的权利和义务，以避免潜在的法律纠纷。
五、综合建议
- 用人单位：应依法履行社保缴纳义务，确保劳动者的合法权益得到保障。在签订劳动合同时，应明确约定社保的缴纳方式和责任，避免使用模糊或违法的条款。
- 劳动者：应关注自己的社保缴纳情况，及时了解并维护自己的权益。如果发现用人单位存在未依法缴纳社保的情况，应及时向劳动保障行政部门投诉或寻求法律援助。
综上所述，工资中是否包含社保补贴的合法性是一个复杂且需要综合考虑多种因素的问题。为了确保双方的权益得到保障，建议用人单位和劳动者在签订劳动合同时务必谨慎对待社保条款，并严格遵守相关法律法规。