“不在职扣款”这个表述，通常指的是员工在非在职状态（比如旷工、离职未交接完毕等）下，公司根据相关规定或合同对其进行的工资或奖金的扣减。不过，更常见且具体的一个例子是“旷工扣款”，下面我将以这个为例，给您详细解释一下。

首先，我们要明确“旷工”的定义：旷工是指员工在没有获得批准或没有履行请假手续的情况下，未到岗上班的行为。对于旷工，公司通常会根据自身的规章制度来处理，其中一种处理方式就是扣款。

关于“旷工一天扣3天工资”这样的规定，其合法性与合理性是存在争议的。

合法性方面：

• 一种观点认为，如果这一规定是公司依法制定的规章制度，并且已经向劳动者公示，那么它可能被视为有效。因为用人单位在不违反法律规定的前提下，根据自身管理需要，有权制定规章制度。
• 另一种观点则认为，这一规定侵犯了劳动者的劳动报酬权，是违法的。因为员工工作一天应获得一天的工资，缺勤一天，公司可不支付当天工资，但多扣的工资（如旷工一天扣3天工资中的多扣部分）则涉嫌克扣。

合理性方面：

• 从劳动者的基本权利出发，劳动报酬权是劳动者的基本权利之一，变相剥夺这一权利显然是不合理的。
• 此外，这一规定也带有经济处分性质，本质上类似于罚款，而罚款的合法性在目前的主流观点中是不被认可的。
• 最后，这一规定也违反了公平原则，劳动者出勤一天只获得一份工资，而旷工一天却要扣去三份工资，这显然是不公平的。

对于旷工行为的合法处理方式：

• 行政处分，直至解除劳动合同。根据旷工天数，公司可以规定不同的处分层级。
• 赔偿损失。如果因旷工导致公司遭受经济损失，公司可以向员工主张损失赔偿。
• 扣减绩效考核分数。将绩效考核分数与绩效工资挂钩，旷工则扣减相应分数，从而降低绩效工资。
• 扣减奖金。在法律上，奖金支付属于企业自主权范畴，公司可以规定旷工则免除当月全部奖金。

综上所述，“不在职扣款”（以旷工扣款为例）的合法性与合理性是存在争议的，且通常不被认为是最佳的处理方式。公司应更倾向于采用合法、合理且公平的方式来处理旷工等违纪行为。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，建议咨询专业的法律人士或劳动仲裁机构以获取更具体的帮助。