结论前置：员工借钱给公司，转账备注为“往来款”从法律角度来说并非完全不合适，但可能存在一定风险，具体需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、转账备注“往来款”的法律含义及潜在风险

1. 法律含义：

   • “往来款”在财务和法律上通常指的是企业或个人之间因业务往来而产生的资金流动，包括但不限于借款、还款、货款、服务费等。将转账备注为“往来款”，从字面上看，并未明确表明该笔款项的性质是借款。

2. 潜在风险：

   • 证明借款关系的难度：若员工与公司之间发生纠纷，员工需证明该笔“往来款”实际上是借款。若缺乏其他证据（如借款合同、借条、聊天记录等），仅凭转账备注“往来款”可能难以充分证明借款关系的存在。
   • 公司财务处理：公司可能将“往来款”视为其他类型的资金流动，如预付款、货款等，从而在财务处理上产生混淆，影响员工权益的保障。

二、如何降低风险

1. 明确借款合同：

   • 员工在借钱给公司时，应与公司签订书面借款合同，明确借款金额、利率、还款期限等关键条款。这是证明借款关系最直接、最有效的证据。

2. 转账备注明确：

   • 尽管转账备注为“往来款”并非完全不合适，但为了降低风险，员工可以在转账时备注更具体的款项性质，如“借款给XX公司”或“XX公司借款”等，以更清晰地表明该笔款项的用途。

3. 保留其他证据：

   • 除了借款合同和转账备注外，员工还应保留其他与借款相关的证据，如聊天记录、邮件往来、公司出具的收款收据等。这些证据可以在发生纠纷时提供有力支持。

三、特殊情况下的处理

1. 若公司已出具借条或借款协议：

   • 若公司已向员工出具了借条或借款协议，并明确了借款金额、利率、还款期限等条款，则转账备注为“往来款”的影响相对较小。因为借条或借款协议本身就是证明借款关系的有力证据。

2. 若发生纠纷：

   • 若员工与公司之间因借款问题发生纠纷，员工应首先尝试与公司协商解决。若协商无果，员工可以依法向人民法院提起诉讼，要求公司偿还借款及利息。在诉讼过程中，员工应提供充分的证据证明借款关系的存在及公司的违约行为。

进一步建议：作为员工，在借钱给公司时，务必谨慎对待转账备注及借款合同的签订。为了保障自己的合法权益，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保借款行为的合法性和有效性。若您有任何关于债务债权方面的法律问题，可以直接向我咨询。