结论：在工伤认定后对劳动关系有异议，可以通过协商调解、劳动仲裁、诉讼程序以及行政投诉与监察等途径来解决。以下是对这些途径的详细分析：

一、劳动关系争议的常见情形与法律依据

在工伤认定过程中，劳动关系的确认是核心前提。若用人单位与劳动者对是否存在劳动关系存在争议，将直接影响工伤认定的进程和结果。根据《工伤保险条例》第十八条，提出工伤认定申请时，需提交与用人单位存在劳动关系的证明材料。而《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）则进一步明确了未签订劳动合同情况下，劳动关系的认定标准，包括工资支付记录、社保缴纳记录、工作证、服务证等身份文件、招工登记表、报名表、考勤记录以及其他劳动者证言等。

二、解决劳动关系争议的途径

1. 协商调解

   • 途径：通过企业工会、劳动争议调解组织协商解决，达成和解协议后可向劳动行政部门备案。
   • 优势：协商调解具有灵活性和高效性，能够快速解决争议，减少双方的时间和成本投入。

2. 劳动仲裁

   • 途径：向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，请求确认劳动关系。
   • 时效要求：自知道权利被侵害之日起一年内提出。
   • 优势：劳动仲裁具有法律强制力，仲裁裁决具有终局性（除非一方在法定期限内提起诉讼），能够为双方提供明确的法律指引。

3. 诉讼程序

   • 途径：对仲裁裁决不服的，可在15日内向法院提起诉讼。
   • 优势：诉讼程序提供了更为全面的法律保障，法院将全面审查证据，依法作出判决，确保双方权益得到公正维护。

4. 行政投诉与监察

   • 途径：向劳动保障监察部门举报用人单位违法行为（如未签合同、拖欠工资），监察部门可介入调查并责令整改。
   • 优势：行政投诉与监察能够迅速响应劳动者的诉求，对用人单位的违法行为进行查处，维护劳动者的合法权益。

三、实务建议

1. 证据收集技巧

   • 保存工作群聊天记录、任务指派邮件、客户签收单等间接证据；
   • 申请劳动仲裁前，可向公证处申请证据保全，确保证据的真实性和有效性。

2. 特殊情形的应对策略

   • 挂靠代缴社保：重点证明实际工作地点、工作内容及管理关系，以证明与用人单位存在事实劳动关系；
   • 退休返聘人员：虽无法认定劳动关系，但可主张人身损害赔偿或通过商业保险覆盖风险，确保自身权益得到保障。

3. 法律援助渠道

   • 经济困难者可向当地司法局申请法律援助，由专业律师代理案件，降低维权成本。

四、典型案例解析

案例：张某在某建筑公司工地受伤，公司否认劳动关系，称张某为包工头李某临时雇佣。 处理过程：

1. 张某提供工地出入证、安全培训记录及公司直接发放的部分工资转账记录；
2. 劳动仲裁委调取公司考勤系统数据，显示张某长期规律打卡；
3. 最终裁定张某与公司存在劳动关系，为后续工伤认定奠定基础。

结论启示：工伤认定中的劳动关系争议需通过多维度证据链还原事实，劳动者应主动固定证据，必要时借助法律程序维护权益。

在处理工伤认定后对劳动关系的异议时，建议您根据自身情况选择合适的途径，并积极收集证据，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。