结论前置：在工厂仅工作两天后自行离职，您仍有权获得这两天的工资，前提是您确实为工厂提供了劳动。工厂不得以“自离”为由拒绝支付工资，除非能证明您的行为给其造成了直接经济损失，并依法进行扣除。
法律背景与依据
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 这意味着，只要您提供了劳动，无论工作时间长短，工厂都有义务支付您相应的工资。
《工资支付暂行规定》第九条：
- 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
- 即使您自行离职，工厂也应在离职时一次性付清您的工资。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：
- 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 如果工厂拖欠或未足额支付您的工资，您可以依法向当地人民法院申请支付令。
特殊情况下的工资扣除
- 如果您的“自离”行为给工厂造成了直接的经济损失，且工厂能够提供相应的证据证明，那么工厂可以按照法律规定从您的工资中扣除相应的赔偿金额。但扣除的部分不得超过您当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
争议解决途径
沟通协商：
- 如果您对工厂的工资支付有疑问或争议，首先应与工厂的人力资源部门或相关负责人进行沟通协商，尝试解决问题。
投诉举报：
- 若沟通无果，您可以向当地的劳动保障监察机构投诉举报，寻求法律帮助和维护自己的合法权益。
实际建议
保留证据：
- 在离职前，尽量保留好与工厂的劳动合同、工作记录、工资条等证据，以便在需要时证明自己的权益。
及时沟通：
- 如果您对工资支付有疑问或不满，及时与工厂沟通，表达自己的诉求和理由，尝试通过协商解决问题。
寻求法律帮助：
- 如果工厂拒绝支付工资或扣除不合理，您可以向我咨询具体的法律途径和维权策略，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
总结：在工厂仅工作两天后自行离职，您仍有权获得这两天的工资。工厂不得以“自离”为由拒绝支付工资，除非能证明您的行为给其造成了直接经济损失，并依法进行扣除。如果您对工资支付有疑问或争议，可以通过沟通协商、投诉举报或寻求法律帮助等途径来维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。