法院在确定劳动关系时，确实会考虑时效问题，但这里的时效主要指的是仲裁时效，而非普通民事诉讼时效，且需遵循仲裁前置程序。以下是对这一问题的详细分析：
一、仲裁时效的法律规定
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这一规定同样适用于确认劳动关系的争议。具体来说：
一般情况：劳动者或用人单位需在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。例如，如果劳动者发现用人单位未与其签订书面劳动合同，且该行为持续存在，那么劳动者应在发现之日起一年内提出仲裁申请，要求确认劳动关系。
中断情况：若因当事人一方向对方主张权利、向有关部门请求权利救济，或对方当事人同意履行义务，仲裁时效将中断，并从中断时起重新计算一年。例如，劳动者书面要求用人单位确认劳动关系，此时仲裁时效中断，从用人单位收到请求时起重算。
中止情况：因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由导致无法按时申请仲裁的，仲裁时效中止，待阻碍因素消除后继续计算。
特殊情形：劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
二、诉讼时效在劳动争议中的不适用
虽然我国民事法律一般原则规定向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，但在劳动争议领域，由于存在仲裁前置程序，诉讼时效的具体应用需结合仲裁法的相关规定。因此，确认劳动关系并不直接适用普通民事诉讼时效，而是应遵循仲裁时效的规定。若对劳动仲裁结果不服，当事人可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，此时需遵循的是民事诉讼的起诉期限，而非诉讼时效。
三、仲裁前置程序的重要性
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议确认劳动关系适用仲裁前置程序，即劳动者在向法院提起诉讼前，必须先经过劳动仲裁程序。这一程序设置有助于快速、高效地解决劳动争议，减轻法院负担，同时保障当事人的合法权益。
四、实际操作建议
鉴于仲裁时效与诉讼时效的规定，建议有确认劳动关系需求的劳动者或用人单位：
尽早收集证据：包括工资卡、工资存折、工资条、社会保险费记录、工作证、服务证等能够证明劳动关系的证据。
及时启动法律程序：在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请，避免因超过时效而丧失法律权利。
注意中断、中止情况：如因特殊原因无法按时申请仲裁，应及时采取措施保护自己的合法权益，如向对方主张权利、向有关部门请求权利救济等，以中断仲裁时效；或因不可抗力等正当理由导致无法申请仲裁的，待阻碍因素消除后继续计算仲裁时效。
综上所述，法院在确定劳动关系时确实会考虑时效问题，但主要依据的是仲裁时效而非普通民事诉讼时效。如有具体法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。