结论前置：过了诉讼时效（这里主要指仲裁时效，因为确认劳动关系需先经过劳动仲裁程序）并不意味着法院完全不会确定劳动关系，但确实会面临一定的法律障碍和风险。具体来说，如果超过了法定的仲裁时效期间，且不存在时效中断或中止的情形，那么劳动仲裁机构可能会不予受理或驳回仲裁申请，进而影响到法院对劳动关系的确认。不过，在特定情况下，如劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制（但劳动关系终止后应自终止之日起一年内提出）。
一、仲裁时效的基本规定
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这一规定同样适用于确认劳动关系的争议。因此，如果劳动者或用人单位希望确认劳动关系，应在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内提出仲裁申请。
二、仲裁时效的中断与中止
时效中断：在仲裁时效期间内，如果因当事人一方向对方当事人主张权利、向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务，仲裁时效将中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。例如，劳动者书面要求用人单位确认劳动关系，此时仲裁时效中断，从用人单位收到请求时起重算。
时效中止：因不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由导致无法按时申请仲裁的，仲裁时效中止。待阻碍因素消除后，仲裁时效期间继续计算。
三、特殊情形下的时效规定
劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制。但需要注意的是，如果劳动关系终止，劳动者应自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请，否则将面临超过时效的风险。
四、超过仲裁时效的法律后果
如果超过了法定的仲裁时效期间，且不存在时效中断或中止的情形，劳动仲裁机构可能会不予受理或驳回仲裁申请。虽然这并不意味着法院完全不会确认劳动关系，但在实践中，由于仲裁是诉讼的前置程序，未经仲裁的劳动争议案件法院通常不会直接受理。因此，超过仲裁时效可能会间接影响到法院对劳动关系的确认。
五、实际操作建议
及时收集证据并提起仲裁申请：劳动者或用人单位在知道或应当知道权利被侵害后，应尽快收集相关证据，并在时效期内向劳动仲裁机构提起仲裁申请，以确保自己的权益得到及时保护。
关注时效中断与中止的情况：在时效期内，如果发生时效中断或中止的情况，应及时了解并保留相关证据，以便在需要时证明时效的延续性。
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综上所述，过了仲裁时效并不意味着法院完全不会确定劳动关系，但确实会面临一定的法律障碍和风险。因此，建议劳动者或用人单位在权利被侵害后及时采取法律行动，以维护自己的合法权益。