结论：公司应赔偿劳动者经济补偿金与劳动者欠公司钱这两个问题，不能在劳动仲裁中一并处理，但可以在劳动仲裁裁决公司支付经济补偿金后，通过协商、诉讼等途径解决劳动者欠公司钱的问题。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动仲裁的适用范围与主体
劳动仲裁是专门用于解决劳动者与用人单位之间在劳动过程中产生的争议的一种制度。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，劳动仲裁处理的是如劳动合同纠纷、工资福利待遇纠纷、社会保险纠纷以及解除或终止劳动合同纠纷等，其争议主体明确为劳动者和用人单位。因此，劳动仲裁的受理范围并不包括劳动者与用人单位之间因非劳动关系产生的经济纠纷，如劳动者欠公司钱的情况。
二、公司应赔偿劳动者经济补偿金与劳动者欠公司钱的性质
公司应赔偿劳动者经济补偿金：这通常发生在劳动合同解除或终止时，用人单位根据法律规定或劳动合同约定，向劳动者支付的一定数额的金钱。这属于劳动争议范畴，可以通过劳动仲裁解决。
劳动者欠公司钱：这通常指的是劳动者在劳动关系存续期间或解除后，因各种原因（如借款、损坏公司财物等）欠付公司的款项。这属于民事经济纠纷范畴，与劳动关系无直接关联，因此不在劳动仲裁的受理范围之内。
三、两者不能一并仲裁处理的原因
由于劳动仲裁的受理范围有限，且劳动者欠公司钱的问题不属于劳动争议范畴，因此这两个问题不能在劳动仲裁中一并处理。如果公司要求劳动者支付欠款，而劳动者同时要求公司支付经济补偿金，双方可以分别通过不同的法律途径来维护自己的权益：
公司要求劳动者支付欠款：公司可以通过协商、调解、民事诉讼等途径来要求劳动者支付欠款。在诉讼过程中，公司需要准备充分的证据材料，如借款合同、付款记录等，以证明欠款事实和金额。
劳动者要求公司支付经济补偿金：劳动者可以通过劳动仲裁来要求公司支付经济补偿金。在劳动仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据，如劳动合同、解除或终止劳动合同的证明等，以证明自己符合获得经济补偿金的条件。
四、建议与注意事项
协商解决：在双方争议不大且愿意协商的情况下，可以尝试通过协商来解决问题。这可以节省时间和成本，并维护双方的关系。
保留证据：无论是公司还是劳动者，在涉及经济纠纷时都应保留好相关证据材料。这有助于在后续的法律程序中证明自己的主张。
依法行事：在处理经济纠纷时，双方都应依法行事，尊重对方的权益。避免采取过激行为或违法手段来解决问题。
寻求专业帮助：如果双方对法律程序或权益保护方面存在疑问或困惑，可以寻求专业律师的帮助。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和代理服务。
综上所述，公司应赔偿劳动者经济补偿金与劳动者欠公司钱这两个问题不能在劳动仲裁中一并处理。双方应分别通过不同的法律途径来维护自己的权益，并在处理过程中保留好相关证据材料、依法行事并寻求专业帮助。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。