施工单位没有开票，建设单位已支付，这确实是一个需要注意的问题，但具体是否构成“大问题”，需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、税务合规角度
发票的法定性：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。因此，施工单位在收到建设单位支付的款项后，有义务开具相应的发票。
未开票的后果：
- 如果施工单位未开具发票，可能面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等。同时，这也可能影响建设单位的税务抵扣和成本核算，进而对建设单位的财务状况产生不利影响。
建设单位的应对措施：
- 建设单位在支付款项后，应要求施工单位及时开具发票。如果施工单位拒绝或无法开具发票，建设单位应保留相关证据（如支付凭证、合同等），并考虑向税务机关举报或采取其他法律措施维护自身权益。
二、合同履行角度
合同条款的约定：
- 双方在签订合同时，应明确约定发票的开具时间、方式、种类等条款。如果合同中有明确约定，施工单位未按照约定开具发票，则构成违约行为。
违约责任的承担：
- 根据合同法的规定，违约方应承担违约责任，包括继续履行、采取补救措施或赔偿损失等。因此，如果施工单位未按照合同约定开具发票，建设单位有权要求施工单位承担相应的违约责任。
三、实际操作建议
沟通协商：
- 在发现施工单位未开具发票后，建设单位应首先与施工单位进行沟通协商，要求其尽快开具发票。通过友好协商，往往可以更快地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
法律途径：
- 如果沟通协商无果，建设单位可以考虑通过法律途径维护自身权益。这包括向税务机关举报、提起民事诉讼或申请仲裁等。在选择法律途径时，建设单位应充分考虑成本、效率等因素，并咨询专业律师的意见。
预防措施：
- 为了避免类似问题的再次发生，建设单位在签订合同时应明确约定发票的开具条款，并在支付款项前要求施工单位提供发票或开具发票的承诺。同时，建设单位还可以考虑在合同中设置违约条款，以约束施工单位的行为。
总结来看，施工单位没有开票而建设单位已支付，虽然不一定直接构成严重的法律问题，但确实存在税务合规和合同履行方面的风险。因此，建设单位应高度重视这一问题，并采取相应的措施进行防范和应对。如果遇到具体问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供更详细的法律建议。