建设方可以付工程款，但存在一定风险，且付款与发票开具是两个不同法律关系，需分情况讨论：

1. 从合同履行角度：

   • 施工方的主要合同义务是完成工程建设并交付合格成果，建设方的主要义务是按约定支付工程款。发票开具通常是施工方的附随义务。若合同未明确将“开具发票”作为付款前提条件，建设方不能仅因施工方未开发票而拒绝付款，否则可能构成违约，需承担逾期付款的违约责任（如支付违约金、利息等）。
   • 若合同明确约定“先开票后付款”或“付款前需提供发票”，则建设方有权以施工方未履行先合同义务为由拒绝付款，直至施工方开具发票。此时，建设方的拒付行为具有合同依据，不构成违约。

2. 从税务合规角度：

   • 即使建设方已付款，若施工方未开具发票，建设方可能面临无法进行税前扣除的风险（如企业所得税、增值税进项抵扣等），导致税务成本增加。因此，建议建设方在付款前要求施工方开具发票，或通过合同约定“付款后一定期限内必须开票”，以降低税务风险。
   • 若施工方拒不开票，建设方可向税务机关举报，由税务机关责令施工方开具发票；若因此造成损失（如多缴税款），建设方可向施工方追偿。

3. 从风险防范角度：

   • 建议操作：建设方可在合同中明确约定发票开具时间、方式及违约责任（如逾期开票需支付违约金），并在付款时要求施工方提供收款收据或书面确认，保留付款凭证。若施工方未开票，建设方可暂扣部分款项（需合同约定支持），或要求施工方出具《未开票情况说明》并承诺补开。
   • 例外情形：若施工方已丧失开票能力（如注销、被吊销营业执照），建设方可凭付款凭证、合同、竣工验收证明等材料，向税务机关申请代开发票或进行税务处理，但流程可能较复杂。

总结：建设方可以付款，但需根据合同约定判断是否享有拒付权；同时，应关注税务合规问题，通过合同条款设计降低风险。若遇纠纷，可依据合同、付款凭证、沟通记录等证据主张权利。如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我咨询。