公司从大小周工作制改为996工作制，这一变更是否违法，需分情况讨论：

1. 若未与劳动者协商一致且未支付加班费：

   • 违法性：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。996工作制意味着劳动者每周工作六天，每天工作12小时（或接近12小时），这明显超出了法定的工作时间上限，且若未与劳动者协商一致，也未支付相应的加班费，则构成违法。
   • 法律后果：用人单位可能面临劳动行政部门的警告、责令改正、罚款等行政处罚，同时劳动者也有权要求用人单位支付加班费，并可能因此解除劳动合同并要求经济补偿。

2. 若与劳动者协商一致并支付了加班费：

   • 违法性：虽然996工作制本身超出了法定的工作时间上限，但如果用人单位与劳动者进行了充分的协商，并得到了劳动者的同意，同时按照法律规定支付了加班费，那么这种工作制在形式上可能不直接构成违法。然而，即便如此，长期实行996工作制也可能对劳动者的身心健康造成严重影响，这并不符合劳动法保护劳动者权益的立法精神。
   • 法律建议：尽管协商一致并支付加班费可能在形式上避免了一些法律风险，但用人单位仍应谨慎考虑劳动者的身心健康和工作效率，避免过度加班。同时，劳动者也有权拒绝不合理的加班要求，并维护自己的合法权益。

3. 特殊行业或岗位的例外情况：

   • 违法性讨论：在某些特殊行业或岗位（如医疗、交通、消防等），由于工作性质的特殊性，可能需要实行更为灵活的工作制。然而，即便如此，用人单位也必须确保劳动者的休息权得到保障，并按照法律规定支付加班费。对于996工作制，除非有特别的法律规定或行业惯例支持，否则很难被视为合法。
   • 法律建议：对于特殊行业或岗位的用人单位和劳动者，应密切关注相关法律法规和行业惯例的变化，确保工作制的合法性和合理性。

总结与建议：

• 996工作制在大多数情况下都是违法的，因为它超出了法定的工作时间上限，且可能对劳动者的身心健康造成严重影响。
• 用人单位应遵守劳动法律法规，合理安排劳动者的工作时间和休息时间，确保劳动者的合法权益得到保障。
• 劳动者在面对不合理的加班要求时，应勇敢维护自己的权益，可以向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。

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