针对您提出的“员工只做了3个月就离职了合同怎么签订及后续处理”的问题，这其实涉及到两个主要方面：一是劳动合同的签订，二是员工离职时的处理流程。下面我将结合相关法律法规，为您详细解答。
一、劳动合同的签订
在员工入职时，无论其预计工作期限长短，都应当与其签订正式的劳动合同。劳动合同是明确双方权利和义务的重要法律文件，对于保障员工权益和用人单位管理都至关重要。对于只计划工作3个月的员工，劳动合同中可以明确约定合同期限为3个月，或者根据实际情况约定更长的期限但注明试用期（如果适用）及转正后的相关条款。不过，若直接约定3个月合同期，则无需特别设置试用期（因为试用期通常包含在合同期内，且试用期长度受法律限制，如合同期3个月至1年的，试用期不得超过1个月）。
二、员工离职时的处理流程
当员工只工作了3个月就提出离职时，处理流程主要依据其是否处于试用期以及用人单位是否存在过错来区分：
试用期内离职：
- 如果劳动合同中约定了试用期，且员工当前处于试用期内，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，员工只需提前三日通知用人单位即可解除劳动合同。
- 离职时，员工应书面通知用人单位（如提交辞职信或邮件），并按公司规定办理工作交接手续，确保业务正常运转。
- 用人单位应按员工实际工作天数结算工资，并出具解除劳动合同的证明。
过了试用期离职：
- 如果劳动合同未约定试用期或已过试用期，员工需提前三十日以书面形式通知用人单位解除劳动合同。
- 离职流程包括提交书面辞职报告、工作交接与配合、办理离职手续（如领取离职证明、结算工资、转移社保和档案等）。
用人单位存在过错时离职：
- 如果用人单位存在未提供约定的劳动保护或条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等违法行为，员工可随时解除劳动合同，无需提前通知，并有权要求经济补偿。
- 经济补偿标准按员工工作年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年按一年计，不满六个月支付半个月工资。
三、注意事项
- 在签订劳动合同时，应明确合同期限、工作内容、工作地点、劳动报酬、社会保险等关键条款，以避免后续纠纷。
- 员工离职时，无论何种情况，都应以书面形式提出辞职申请，以确保法律效力。
- 如遇困难或问题，员工可向当地劳动监察部门寻求帮助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
综上所述，对于只工作3个月就离职的员工，用人单位应依法签订劳动合同，并在员工离职时按照法律规定和合同约定处理相关事宜，以保障双方的合法权益。