在审查起诉阶段发现新罪时，检察机关会根据新罪与原案的关系及具体情况，采取不同的处理措施。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、新罪与原案的关系判断

1. 同一犯罪事实或关联犯罪

   • 若新罪与原案属于同一犯罪事实（如连续作案、共同犯罪中的遗漏罪行）或与原案存在密切关联（如上下游犯罪），检察机关应一并处理。例如，甲涉嫌盗窃被移送审查起诉，审查中发现甲还有同案的抢劫行为，两罪均基于甲的非法占有目的，属于关联性犯罪，此时检察机关应将两罪合并审查起诉。

2. 独立的新罪

   • 若新罪与原案无直接关联（如甲在盗窃期间另犯诈骗罪），则需分情况处理。这种情况下，新罪可能涉及不同的犯罪事实、犯罪主体或管辖权，因此需要单独进行审查起诉。

二、具体处理方式

（一）同一或关联犯罪的处理

1. 补充侦查或自行侦查

   • 检察机关可要求公安机关补充侦查新罪证据（《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条），或直接自行侦查（第一百九十一条）。例如，若新罪涉及境外取证困难，检察机关可通过司法协助程序获取证据。

2. 追加起诉

   • 若证据确实充分，检察机关应在原起诉书基础上追加新罪指控（《人民检察院刑事诉讼规则》第三百五十八条）。例如，乙因受贿被起诉，审查中发现乙还有巨额财产来源不明罪，检察机关需追加该罪名。

（二）独立新罪的处理

1. 分案处理原则
   • 若新罪与原案无直接关联且已达到追诉标准，原则上应分案处理：
     • 退回公安机关另行立案侦查：将新罪线索移送公安机关，由其按程序立案侦查后移送起诉。例如，丙因贩毒被起诉，审查中发现丙另有非法持有枪支罪，检察机关应将枪支案退回公安机关。
     • 并案处理的例外情形：若新罪与原案需合并审理（如同一被告人、同案犯未归案等），可协商法院并案审理（《刑诉法解释》第十三条）。例如，丁因故意伤害被起诉，审查中发现丁在案发前还参与了一起寻衅滋事，但同案犯尚未到案，此时可与法院协商并案。

三、特殊情形的处理

1. 管辖权问题

   • 若新罪属其他检察院管辖，应通过指定管辖或移送管辖解决（《刑事诉讼法》第二十六条）。例如，戊在省A市作案后被省B市抓获，审查中发现戊在省C市还有漏罪，需协调三省检察机关确定管辖。

2. 证据不足的处理

   • 若新罪证据不足，检察机关不得强行起诉，可要求补侦或作出不起诉决定（《刑事诉讼法》第一百七十五条、第一百七十七条）。例如，己涉嫌职务侵占被起诉，审查中怀疑己有挪用资金行为但证据链断裂，检察机关应存疑不诉。

四、程序保障与监督

1. 犯罪嫌疑人权利保障

   • 必须告知犯罪嫌疑人新增罪名及辩护权利，听取辩护人意见（《刑事诉讼法》第三十四条）。这是保障犯罪嫌疑人合法权益的重要环节，也是确保案件公正处理的基础。

2. 内部监督机制

   • 通过部门分离（如捕诉分离）、案件评查等方式防止滥用权力。这有助于确保检察机关在处理新罪时遵循法定程序，避免权力滥用和司法不公。

3. 审判监督

   • 若法院对检察机关追加起诉的罪名未予认定，检察机关可依法提出抗诉（《刑事诉讼法》第二百二十八条）。这是检察机关对审判活动进行监督的重要方式，也是确保案件公正处理的重要保障。

总结来说，在审查起诉阶段发现新罪时，检察机关会根据新罪与原案的关系及具体情况采取不同的处理措施。这些措施旨在确保案件的公正、高效处理，同时保障犯罪嫌疑人的合法权益。如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。