结论：从法律和财务规范角度，对方公司退回款项时备注“还款”在多数情况下可行，但需结合具体交易背景和双方约定综合判断，以下分情况详细说明：

情况一：双方无争议，仅因交易取消或调整需退款

若双方对交易取消或调整无争议，对方公司退回款项时备注“还款”法律上可行。此时“还款”备注可理解为对之前收到货款的返还，本质是合同履行过程中的退款行为，不涉及新的债权债务关系。但需注意：

1. 财务规范：若双方财务制度严格，建议备注“退款”或“货款退回”，更符合财务记账规范，避免后续审计或税务核查时产生疑问。
2. 合同约定：若合同中明确约定退款流程或备注要求，应优先按合同执行，避免因备注不符引发纠纷。

情况二：双方存在争议，对方主张退款系偿还其他债务

若双方存在其他经济往来或争议，对方公司退回款项时备注“还款”可能引发法律风险。此时“还款”备注可能被解读为对方主张该款项系偿还其他债务（如借款、预付款等），而非单纯退回货款。若您不认可对方主张，可能面临以下问题：

1. 举证责任：若对方以“还款”备注主张款项性质，您需提供证据证明该款项实为货款退回，否则可能承担不利后果。
2. 合同履行：若对方主张该款项系偿还其他债务，可能影响原货款合同的履行状态，甚至引发新的纠纷。

建议操作

1. 沟通确认：在对方退款前，建议与对方公司明确退款原因和款项性质，并要求对方在备注中注明“货款退回”或“退款”，避免歧义。
2. 书面确认：若双方对退款性质有争议，建议通过书面协议（如补充协议、退款确认书）明确款项性质和退款原因，固定证据。
3. 财务处理：收到退款后，建议您公司财务部门根据实际交易情况正确记账，避免因备注不符导致财务混乱或税务风险。

若您在交易过程中遇到其他法律问题，欢迎直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供专业建议。