针对您提出的“员工怀孕后加班怎么处理”的问题，以下是根据相关法律法规及政策给出的详细解答：
首先，我们要明确的是，根据《中华人民共和国劳动法》以及《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，女职工在孕期享有特殊的劳动保护权益。具体来说，对于怀孕的女职工，用人单位在安排工作时需要遵循以下原则：
不得安排高强度劳动和禁忌活动：
- 女职工在怀孕期间，不得被安排从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动以及孕期禁忌从事的活动。这是为了保护女职工和胎儿的健康，避免过度劳累和潜在的危险。
对怀孕7个月以上的女职工有特别保护：
- 对于怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长其劳动时间或安排夜班劳动。这是考虑到怀孕后期女职工的身体负担加重，需要更多的休息和照顾。
- 同时，用人单位还应当在劳动时间内为怀孕7个月以上的女职工安排一定的休息时间，以确保其身体得到充分的恢复。
根据医疗机构证明调整工作安排：
- 如果怀孕女职工在孕期不能适应原劳动，用人单位应当根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或者安排其他能够适应的劳动。这是为了确保女职工在孕期能够保持健康的工作状态，同时避免对胎儿造成不良影响。
保障产前检查时间：
- 怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查所需的时间，应当计入劳动时间。这意味着用人单位不得因女职工进行产前检查而扣除其工资或视为缺勤。
工资和福利待遇不受影响：
- 用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动合同。这是为了保障女职工在孕期的经济权益和职业稳定性。
针对您提出的具体问题“员工怀孕后加班怎么处理”，结合上述原则，我们可以得出以下结论：
- 对于怀孕不满7个月的女职工，如果其身体状况良好且能够适应原劳动，用人单位可以安排其正常工作，但应避免安排高强度劳动和禁忌活动。同时，如果女职工提出需要减少加班或调整工作安排，用人单位应当根据实际情况予以考虑和调整。
- 对于怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得安排其延长劳动时间或安排夜班劳动。如果女职工因身体原因需要保胎休息或上班确有困难，用人单位应当根据医疗机构的证明安排其休息，并确保其工资和福利待遇不受影响。
最后，如果用人单位违反相关法律法规侵害女职工的合法权益，女职工可以依法投诉、举报、申诉，并向劳动人事争议调解仲裁机构申请调解仲裁。对仲裁裁决不服的，还可以依法向人民法院提起诉讼。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。