肇事逃逸后，即便与对方协商好了赔偿等事宜，仍然可能需要接受扣分、罚款等行政处罚，甚至可能面临刑事处罚。以下是对此问题的详细分析：
一、行政责任层面
扣分与罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，肇事逃逸属于严重违反交通管理法规的行为。公安机关交通管理部门有权对逃逸者进行行政处罚，包括罚款（200元以上2000元以下）和扣分（通常一次性扣12分）。
- 扣分和罚款是行政处罚的常见形式，旨在惩戒逃逸行为，维护道路交通秩序。
吊销驾驶证：
- 肇事逃逸者还可能面临吊销机动车驾驶证的处罚，且终生不得重新取得机动车驾驶证。这一处罚措施更为严厉，旨在防止类似行为再次发生。
行政拘留：
- 在某些情况下，公安机关还可能对逃逸者处以15日以下的行政拘留。拘留作为一种强制措施，旨在对逃逸者进行惩戒，并向社会传递出对肇事逃逸行为零容忍的态度。
二、民事责任层面
- 虽然双方可以通过协商达成和解，解决民事赔偿问题，如赔偿医疗费、误工费、护理费、车辆维修费用等各项损失，但协商并不能改变肇事逃逸行为的违法性质，也不能替代法律程序对逃逸者的处理。
- 肇事逃逸者仍需按照和解协议履行赔偿义务，但这并不免除其应承担的行政和刑事责任。
三、刑事责任层面
构成交通肇事罪：
- 如果肇事逃逸行为导致他人重伤、死亡或者公私财产遭受重大损失，逃逸者将面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》，交通肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
量刑考虑因素：
- 在量刑过程中，法院会综合考虑多种因素，包括犯罪情节、悔罪表现以及是否获得被害人谅解等。虽然被害人的谅解可以在一定程度上影响量刑结果，法院可能会酌情从轻处罚，但并不能完全免除刑事责任。
四、特殊情况说明
- 在肇事逃逸行为尚未构成犯罪，且情节相对较轻的情况下，如果肇事者积极与被害人协商赔偿事宜，并取得了被害人的书面谅解，公安机关在综合考虑各种因素后，有可能作出不予拘留的决定。但扣分和罚款等行政处罚通常仍会执行。
- 若事故中未造成人员伤亡，仅涉及财产损害，且肇事者表现出坦诚认错的态度并愿意积极赔偿受害者的经济损失，同时证明自己并非故意逃避追责并积极配合交警部门的调查与处理，那么肇事者有可能在行政处罚上得到一定程度的减轻，但扣分和罚款等基本处罚仍难以避免。
五、建议与提醒
- 发生交通事故后，特别是涉及肇事逃逸的情况，应及时报警以便交通管理部门介入调查。切勿选择逃逸，以免面临更严重的法律后果。
- 在处理事故和协商过程中，双方应妥善保留相关证据，如现场照片、医疗记录、维修发票等，以备后续法律程序之需。
综上所述，肇事逃逸后双方协商好了仍然需要承担法律责任。协商虽然可以解决民事赔偿问题，但并不能免除肇事逃逸者应承担的行政和刑事责任。因此，在发生交通事故后，应依法处理并积极配合相关部门的调查和处理工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。