您好，关于您提出的“肇事逃逸后双方协商好会怎样处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，肇事逃逸是一种严重的违法行为，它违反了交通管理法规，并可能对他人的生命财产安全造成严重威胁。因此，即使事故双方已经就民事赔偿部分达成了协议，肇事逃逸者依然需要承担相应的法律责任。

一、行政责任

肇事逃逸者将面临公安机关交通管理部门的行政处罚。这通常包括罚款，金额在200元以上2000元以下，同时可能会被吊销机动车驾驶证，且终生不得重新取得。在某些严重情况下，还可能对逃逸者处以15日以下的行政拘留。

二、民事责任

尽管双方可以通过协商达成和解，但肇事逃逸者仍需对受害者的实际损失进行赔偿。这包括但不限于医疗费、误工费、护理费、车辆维修费用等。和解协议应明确赔偿金额和支付方式，逃逸者需严格按照协议履行赔偿义务。

三、刑事责任

如果肇事逃逸行为导致他人重伤、死亡或者公私财产遭受重大损失，逃逸者将面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，交通肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑。因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。

四、协商与处罚的关系

双方协商主要解决的是民事赔偿问题，它并不能改变肇事逃逸行为的违法性质，也不能替代法律程序对逃逸者的处理。交通管理部门和司法机关会根据法律规定对肇事逃逸行为进行独立的调查和处理。协商结果可以作为量刑或行政处罚的参考因素，但并不能完全替代法律程序。

五、建议与提醒

1. 在发生交通事故后，特别是涉及肇事逃逸的情况，应及时报警以便交通管理部门介入调查。
2. 在处理事故和协商过程中，双方应妥善保留相关证据，如现场照片、医疗记录、维修发票等，以备后续法律程序之需。
3. 涉及肇事逃逸的法律问题较为复杂，建议双方咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助，确保自身权益得到充分保护。

综上所述，肇事逃逸后双方协商好了仍然需要承担法律责任。协商虽然可以解决民事赔偿问题，但并不能免除肇事逃逸者应承担的行政和刑事责任。因此，在发生交通事故后，请务必依法处理并积极配合相关部门的调查和处理工作。