结论：肇事逃逸后，即使双方已经协商好了赔偿等事宜，肇事者仍有可能面临处罚，具体取决于肇事行为的严重性、是否构成犯罪以及是否存在其他严重情节。以下是对此问题的详细分析：

一、肇事逃逸的法律性质

肇事逃逸是一种严重的违法犯罪行为，其违法性不会因事后的协商而消失。根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，一旦发生交通事故，驾驶者有义务立即停车、保护现场、抢救伤者并报警处理。选择逃逸将触犯法律底线，并可能承担严重的法律责任。

二、协商对法律责任的影响

1. 民事赔偿与刑事责任：双方达成的协商主要针对民事赔偿部分，如赔偿金额、赔偿方式等。然而，这种协商并不会影响对肇事逃逸行为的刑事或行政处罚。即使肇事者与受害者就民事赔偿问题达成了协议，肇事者仍然需要承担因逃逸行为而产生的法律责任，包括可能的罚款、拘留和刑事处罚。

2. 行政处罚的独立性：肇事逃逸行为的处罚属于行政处罚范畴，不会因为双方协商解决而免于处罚。罚款、吊销驾驶证以及可能的拘留等行政处罚措施，旨在对逃逸者进行惩戒，防止其再次逃避法律责任，并向社会传递出对肇事逃逸行为零容忍的态度。

三、可能面临的处罚情况

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，并可以并处十五日以下拘留。

2. 刑事处罚：

   • 如果肇事逃逸行为构成了交通肇事罪，如造成重大事故致人重伤、死亡或使公私财产遭受重大损失，则将面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
   • 在这种情况下，即使双方协商好了赔偿等事宜，肇事者仍然可能被依法拘留，并面临刑事审判和可能的刑罚。

四、建议与提醒

1. 及时报警并配合调查：发生交通事故后，特别是涉及肇事逃逸的情况，应及时报警以便交通管理部门介入调查。同时，应积极配合公安机关的调查和处理工作，如实陈述事实，提供必要证据。

2. 重视民事责任与刑事责任的区别：虽然民事赔偿的协商结果可能在一定程度上影响量刑或行政处罚的幅度，但并不能完全替代或减轻刑事责任。肇事者应充分认识到自己行为的严重性，并积极承担相应的法律责任。

3. 寻求法律帮助：如果你或他人涉及肇事逃逸的法律问题，建议直接向我咨询以获取准确的法律意见和帮助。我将根据具体情况为你提供专业的法律分析和建议。

综上所述，肇事逃逸后双方协商好了仍然需要承担法律责任。协商虽然可以解决民事赔偿问题，但并不能免除肇事逃逸者应承担的行政和刑事责任。因此，在发生交通事故后，应依法处理并积极配合相关部门的调查和处理工作。