在职业病诊断有异议的情况下，是否可以申请劳动仲裁，需视具体争议内容而定。以下是对此问题的详细分析：
劳动关系争议：
- 若劳动者与用人单位对双方是否存在劳动关系产生分歧，这种争议会直接影响职业病诊断中对接触职业病危害因素的认定。例如，用人单位否认劳动关系，而劳动者认为存在事实劳动关系。此时，劳动者可以申请劳动仲裁，以确定劳动关系的真实性，为职业病诊断提供基础依据。
工种、工作岗位争议：
- 对于劳动者具体从事的工种、工作岗位，若双方认识不一致，由于不同工种和岗位接触的职业病危害因素不同，准确认定对职业病诊断至关重要。例如，劳动者主张自己长期从事高危岗位，而用人单位则认为其岗位风险较低。在这种情况下，劳动者或用人单位均可申请仲裁，以明确工种和工作岗位。
在岗时间争议：
- 在岗时间的长短对于判断职业病与工作环境的关联程度具有关键作用。若劳动者与用人单位对在岗时间存在争议，如劳动者认为自己长期在某一岗位工作，而用人单位记录的在岗时间较短，这种差异会直接影响职业病诊断结论。因此，劳动者或用人单位可以通过仲裁来确定准确的在岗时间。
对工作场所职业病危害因素检测结果等资料有异议：
- 若劳动者对用人单位提供的工作场所职业病危害因素检测结果或其他相关资料（如职业健康监护档案）的真实性、完整性或准确性有异议，且这些资料是职业病诊断的重要依据，那么劳动者可以申请仲裁，由仲裁机构对资料的有效性进行审查和判定。
申请仲裁的流程与注意事项：
- 提出申请：当事人需向当地的劳动人事争议仲裁委员会提出仲裁申请，并提交相关证据材料以支持自己的主张。
- 受理与裁决：劳动人事争议仲裁委员会在接到申请后，应当受理并在规定时间内（通常为三十日内）作出裁决。该裁决结果对后续的职业病诊断、鉴定工作具有重要的参考作用。
- 举证责任：在仲裁过程中，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。若劳动者无法提供由用人单位掌握管理的与仲裁主张有关的证据，仲裁庭可以要求用人单位在指定期限内提供；若用人单位在指定期限内不提供，则应承担不利后果。
- 后续法律途径：若用人单位对仲裁裁决不服，可以在职业病诊断、鉴定程序结束之日起十五日内依法向人民法院提起诉讼。在诉讼期间，劳动者的治疗费用应按照职业病待遇规定的途径支付，确保劳动者的合法权益得到保障。
综上所述，在职业病诊断有异议的情况下，若涉及劳动关系、工种、工作岗位、在岗时间或对工作场所职业病危害因素检测结果等资料的争议，当事人可以依法向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。