职业病鉴定过程中，若遇到特定争议，是可以申请仲裁的。以下是详细的分析和解答：
可申请仲裁的情形
劳动关系争议：
- 当劳动者与用人单位对双方是否存在劳动关系产生分歧时，这种争议会直接影响职业病诊断中对接触职业病危害因素的认定。例如，用人单位可能否认与劳动者存在劳动关系，而劳动者则认为存在事实劳动关系。此时，通过仲裁可以确定劳动关系的真实性，为职业病诊断提供基础依据。
工种、工作岗位争议：
- 劳动者具体从事的工种和工作岗位是职业病诊断中的重要因素，因为不同工种和岗位接触的职业病危害因素不同。若双方对工种和工作岗位的认识不一致，如劳动者主张自己长期从事高危岗位，而用人单位则认为其岗位风险较低，此时可通过仲裁来明确工种和工作岗位，确保职业病诊断的准确性。
在岗时间争议：
- 在岗时间的长短对于判断职业病与工作环境的关联程度具有关键作用。若劳动者与用人单位对在岗时间存在争议，如劳动者认为自己长期在某一岗位工作，而用人单位记录的在岗时间较短，这种差异会直接影响职业病诊断结论。因此，可以通过仲裁来确定准确的在岗时间，为职业病诊断提供有力支持。
对工作场所职业病危害因素检测结果等资料有异议：
- 若劳动者对用人单位提供的工作场所职业病危害因素检测结果或其他相关资料（如职业健康监护档案）的真实性、完整性或准确性有异议，且这些资料是职业病诊断的重要依据，那么当事人可以申请仲裁。仲裁机构将对资料的有效性进行审查和判定，确保职业病诊断的公正性和准确性。
申请仲裁的流程与注意事项
提出申请：
- 当事人需向当地的劳动人事争议仲裁委员会提出仲裁申请，并提交相关证据材料以支持自己的主张。证据材料应包括与争议事项相关的劳动合同、工资单、工作记录、职业病危害因素检测结果等。
受理与裁决：
- 劳动人事争议仲裁委员会在接到申请后，应当受理并在规定时间内（通常为三十日内）作出裁决。裁决结果对后续的职业病诊断、鉴定工作具有重要的参考作用。若当事人对裁决结果不服，可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
举证责任：
- 在仲裁过程中，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。若劳动者无法提供由用人单位掌握管理的与仲裁主张有关的证据，仲裁庭可以要求用人单位在指定期限内提供。若用人单位在指定期限内不提供，则应承担不利后果。
后续法律途径：
- 若用人单位对仲裁裁决不服，可以在职业病诊断、鉴定程序结束之日起十五日内依法向人民法院提起诉讼。在诉讼期间，劳动者的治疗费用应按照职业病待遇规定的途径支付，确保劳动者的合法权益得到保障。
法律建议
- 在职业病鉴定过程中，若遇到上述争议情形，建议劳动者及时咨询专业律师，了解自己的权益和可行的法律途径。
- 劳动者应保留好与争议事项相关的证据材料，如劳动合同、工资单、工作记录等，以便在仲裁或诉讼过程中提供有力支持。
- 若用人单位拒绝提供相关证据或拒绝配合仲裁程序，劳动者可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
综上所述，职业病鉴定过程中若遇到特定争议，是可以申请仲裁的。劳动者应了解自己的权益和可行的法律途径，及时咨询专业律师并保留好相关证据材料，以便在仲裁或诉讼过程中维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。