员工补交社保时，不可以仅先交本金，这样的操作是不合法的。下面我来详细解释一下：

1. 社保缴纳规定：社保缴纳是按照一定比例由个人和公司共同承担的，这包括了养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。这些保险项目的缴纳比例和基数都有明确的规定，不能仅缴纳本金部分。

2. 合法性分析：如果员工试图仅补交社保的本金部分，而忽略其他应缴部分，这将违反社保缴纳的相关规定。社保制度是为了保障员工在面临各种风险时能够获得一定的经济保障，因此，按照规定的比例和基数缴纳社保是每位员工的义务，也是保障自身权益的重要方式。

3. 建议与操作：如果员工发现社保有欠缴或需要补交的情况，应该及时与公司的人力资源部门或社保机构联系，了解具体的补交流程和规定。在补交社保时，应确保按照规定的比例和基数进行缴纳，以确保自己的权益得到充分保障。

综上所述，员工补交社保时不能仅先交本金，这样的操作是不合法的。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。