结论：机关免于起诉后能否恢复原职，需根据具体情况判断，主要取决于免于起诉的原因、单位规定以及相关法律法规。以下从不同角度进行分析：

1. 免于起诉的原因

• 因证据不足或情节轻微免于起诉：如果免于起诉是因为证据不足或情节轻微，且该行为并未构成严重违纪或违法，那么恢复原职的可能性较大。但具体还需看单位的规定和态度，有些单位可能会根据内部规章制度进行相应处理，如警告、记过等，而不直接开除或辞退。
• 因特定政策或程序免于起诉：在某些情况下，如涉及特定政策（如自首、立功等）或程序（如刑事和解、附条件不起诉等）而免于起诉，恢复原职的可能性也相对较大。但同样需要单位根据具体情况进行决定。
• 因严重违纪或违法但情节轻微免于起诉：如果免于起诉的行为虽然情节轻微，但属于严重违纪或违法范畴（如贪污受贿但数额较小、滥用职权但未造成严重后果等），那么恢复原职的可能性就较小。单位可能会根据内部规定或相关法律法规进行严肃处理，如开除、辞退或降职等。

2. 单位规定

• 不同单位对于员工涉及法律问题的处理方式可能不同。有些单位可能更加宽容，愿意给予员工改正的机会；而有些单位则可能更加严格，一旦员工涉及法律问题就立即开除或辞退。
• 因此，在免于起诉后，能否恢复原职还需参考单位的具体规定和态度。如果单位有明确的规章制度或政策文件对此进行规定，那么应按照规定执行。

3. 相关法律法规

• 根据《中华人民共和国公务员法》等相关法律法规，公务员因违纪违法应当承担纪律责任的，依照本法给予处分；违纪违法行为情节轻微，经批评教育后改正的，可以免予处分。但免予处分并不意味着可以恢复原职，具体还需看违纪违法的性质和情节。
• 对于非公务员身份的员工，如企业员工等，其恢复原职的问题则主要依据劳动合同、公司章程以及相关法律法规进行判断。如果劳动合同或公司章程中有明确规定，则应按照规定执行；如果没有明确规定，则需根据具体情况进行协商或诉讼解决。

4. 实际操作建议

• 主动沟通：在免于起诉后，建议主动与单位沟通，说明情况并表达改正的决心和态度。这有助于增加单位对你的信任和理解，提高恢复原职的可能性。
• 了解规定：在沟通前，建议先了解单位的相关规定和政策文件，以便更好地说明自己的情况和诉求。
• 寻求法律援助：如果单位拒绝恢复原职且你认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务以及可能的法律途径。

总结：机关免于起诉后能否恢复原职并没有一个确定的答案，而是需要根据具体情况进行判断。如果你面临这样的问题，建议主动与单位沟通并了解相关规定和政策文件，同时也可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师以维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。