结论前置：工伤后住院报销款打给了个人账户，要求企业出具证明是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，若该证明仅用于确认报销款接收情况或相关事实，且不违反法律法规，企业出具证明是合法的；但若证明内容涉及不实信息或违反法律法规，则企业有权拒绝出具。
详细分析：
证明内容的合法性：
- 企业出具的证明应当基于真实事实，且内容合法合规。如果证明仅用于确认工伤员工已收到住院报销款，或者用于说明报销款的支付情况等，且这些信息是真实准确的，那么企业出具这样的证明是合法的。
- 如果证明内容涉及不实信息，如虚构报销金额、伪造支付记录等，或者证明的用途违反了法律法规（如用于逃税、诈骗等），那么企业不仅有权拒绝出具，还可能因此承担法律责任。
企业出具证明的义务与权利：
- 在一般情况下，企业没有义务为员工出具与工伤无关的证明。但如果证明内容与工伤相关，且是为了处理工伤事宜（如申请工伤赔偿、报销医疗费用等），企业应当根据实际情况和法律法规的要求，配合员工出具相关证明。
- 同时，企业也有权拒绝出具不真实、不合法或违反其内部规定的证明。如果员工要求企业出具的证明内容不实或违法，企业有权拒绝，并可以告知员工相关法律法规和企业的规定。
实际操作中的建议：
- 对于员工而言，如果需要企业出具证明，应当明确证明的具体内容和用途，并确保这些内容真实合法。同时，员工也可以与企业沟通，了解企业出具证明的具体要求和流程。
- 对于企业而言，在出具证明前应当仔细审核证明内容，确保其真实合法。如果员工提出的证明要求不合理或违法，企业应当明确拒绝，并可以建议员工通过合法途径解决问题。
可能涉及的法律后果：
- 如果企业出具了不真实的证明，可能会因此承担法律责任，如被追究伪造证据、虚假陈述等法律责任。
- 如果员工利用企业出具的证明进行违法活动，如诈骗、逃税等，企业也可能因此受到牵连和处罚。
总结与建议：
工伤后住院报销款打给了个人账户，要求企业出具证明是否合法，需根据证明的具体内容和用途来判断。企业应当基于真实事实和法律法规的要求来出具证明，并有权拒绝不真实、不合法或违反其内部规定的证明要求。员工在要求企业出具证明时，也应当明确证明的具体内容和用途，并确保其真实合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。