关于公司没有打卡制度时如何计算上下班及工资的问题，这确实是一个涉及员工权益和公司管理的重要方面。以下是我为您提供的详细分析：
一、公司无打卡制度时的上下班认定
公司规定与沟通：
- 首先，公司应明确是否有其他形式的考勤记录方式，如工作日志、项目进度报告、会议签到等。
- 若公司确实没有明确的考勤制度，员工应与公司管理层或人力资源部门进行沟通，了解公司对于上下班时间的具体要求和期望。
员工自我管理：
- 在没有打卡制度的情况下，员工应更加注重自我管理，确保按时上下班，并保留好相关的工作记录，如工作邮件、工作成果等，以证明自己的出勤情况。
二、工资计算方式
有合理原因未打卡（虽无打卡但实际出勤）：
- 若因公司系统故障、外出办公等合理原因导致无法打卡，但员工实际上提供了正常劳动，公司应按照正常出勤标准计算工资。
- 工资计算应依据劳动合同约定的工资计算方式，结合实际工作天数、小时数进行核算。
无合理原因未打卡但能证明出勤：
- 若员工忘记打卡，但能通过工作记录、同事证言、客户证明等方式证明自己出勤，公司应根据实际情况酌情处理。
- 若公司规章制度中有明确规定（如每次未打卡扣当日工资的X%），则按规定执行；若无明确规定，原则上应按正常出勤支付工资，避免随意克扣。
无合理原因未打卡且无法证明出勤：
- 若员工既无打卡记录又无法提供其他有效证据证明自己出勤，公司可依据合法有效的规章制度视为缺勤行为处理。
- 工资扣减应符合法律规定和规章制度约定，如旷工一天扣发相应天数的工资，但不得过度扣减或违反法律法规。
三、建议与注意事项
公司层面：
- 公司应尽快建立或完善考勤制度，明确上下班时间、考勤方式及工资计算方式，确保公平性和透明度。
- 在处理未打卡情况时，公司应综合考虑员工工作表现、实际出勤等因素，合理确定工资，避免引发纠纷。
员工层面：
- 员工应了解公司考勤制度（如有），并遵守相关规定。
- 在没有打卡制度的情况下，员工应保留好工作记录，以备不时之需。
- 若出现争议，员工应及时与公司沟通协商，或寻求专业法律帮助来维护自己的合法权益。
综上所述，公司没有打卡制度时，上下班的认定和工资的计算应综合考虑多种因素。公司应确保考勤和工资计算方式的公平性和透明度，员工也应了解自己的权益和义务，并遵守公司规定。在出现争议时，双方应积极沟通协商，或寻求专业法律机构的帮助来维护各自的合法权益。