孕期期间事业单位考核基本合格并不违法。具体分析如下：

首先，我们需要明确的是，孕期女性员工在事业单位工作中，享有特殊的劳动保护，但这并不意味着她们可以免于工作考核。考核是评估员工工作表现的一种方式，也是事业单位管理员工的重要手段。

其次，关于“基本合格”的考核评定，这通常意味着员工在工作中的表现达到了基本要求，但可能还有一些需要改进的地方。这种评定并不等同于“不合格”，也不代表员工在工作中存在严重问题。因此，从法律角度来看，事业单位对孕期女性员工进行考核，并给予“基本合格”的评定，并不违反相关法律法规。

当然，事业单位在进行考核时，应当充分考虑孕期女性员工的特殊情况，避免安排过于繁重或危险的工作任务，确保她们的身体健康和胎儿的安全。同时，如果孕期女性员工对考核评定有异议，她们可以通过正当途径提出申诉，维护自己的合法权益。

综上所述，孕期期间事业单位考核基本合格并不违法，但事业单位应当充分考虑孕期女性员工的特殊情况，并保障她们的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。