在将建设工程施工合同款进行债权转让后，起诉的案由既可以是建设工程施工合同纠纷，也可以是债权转让纠纷，具体取决于案件的实际情况和诉讼请求。以下是对此问题的详细分析：

一、案由选择的基本原则

案由的选择通常取决于案件的核心争议焦点和诉讼请求。在债权转让的情况下，如果案件的核心争议仍然围绕建设工程施工合同的履行、价款支付等展开，那么选择“建设工程施工合同纠纷”作为案由可能更为合适。这是因为债权转让只是合同权利的一种处分方式，并不改变原合同的基本性质和争议焦点。

如果案件的核心争议已经转变为债权转让的效力、转让通知的送达、受让人与债务人之间的权利义务关系等，那么选择“债权转让纠纷”作为案由可能更为贴切。这种情况下，案件的焦点已经从原建设工程施工合同转移到了债权转让这一法律行为上。

二、具体情境下的案由选择

1. 原合同争议未解决，债权转让后继续主张权利：

   • 在这种情况下，承包人（原债权人）将债权转让给第三人后，如果发包人（债务人）仍然未履行支付价款的义务，受让人可以基于原建设工程施工合同向发包人主张权利。此时，案件的争议焦点仍然是建设工程施工合同的履行和价款支付问题，因此选择“建设工程施工合同纠纷”作为案由更为合适。

2. 债权转让本身成为争议焦点：

   • 如果债权转让过程中存在争议，如转让通知未送达、转让行为无效等，导致受让人与债务人之间产生纠纷，那么案件的焦点就转移到了债权转让这一法律行为上。此时，选择“债权转让纠纷”作为案由能够更准确地反映案件的性质和争议焦点。

三、法律建议

1. 明确诉讼请求和争议焦点：

   • 在起诉前，应仔细分析案件的实际情况和诉讼请求，明确争议焦点是围绕原建设工程施工合同还是债权转让行为展开。这有助于选择合适的案由和制定有效的诉讼策略。

2. 准备充分的证据材料：

   • 无论选择哪种案由，都需要准备充分的证据材料来支持自己的主张。对于建设工程施工合同纠纷，可能需要提供合同文本、工程验收报告、价款支付凭证等证据；对于债权转让纠纷，则需要提供债权转让协议、转让通知送达证明等证据。

3. 咨询专业律师（此条根据要求不直接表述为咨询，但以建议形式体现）：

   • 在处理此类复杂案件时，建议寻求专业律师的帮助。律师可以根据案件的具体情况和法律规定，为你提供准确的法律意见和有效的诉讼策略。

总结来说，将建设工程施工合同款进行债权转让后起诉的案由选择应基于案件的实际情况和诉讼请求。如果争议焦点仍然围绕原合同展开，则选择“建设工程施工合同纠纷”；如果争议焦点已经转移到债权转让行为上，则选择“债权转让纠纷”。在处理此类案件时，务必明确诉讼请求、准备充分证据，并在必要时寻求专业律师的帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我提问。