员工上下班发生事故，医疗费的承担问题需根据事故是否构成工伤来具体分析。以下是对此问题的详细解答：
若事故构成工伤：
- 认定条件：根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这意味着，如果员工在上下班途中因交通事故受伤，且该事故非员工本人主要责任，那么该事故应被认定为工伤。
- 费用承担：一旦事故被认定为工伤，相关医疗费用将由工伤保险基金支付。如果用人单位已依法为职工缴纳工伤保险，职工无需担心医疗费用问题。若用人单位未依法缴纳工伤保险费，则应由用人单位按照工伤保险待遇项目和标准支付费用，包括医疗费用、住院伙食补助费、伤残补助金等。
若事故不构成工伤：
- 一般情况：如果员工在上下班途中发生的事故不构成工伤，比如因个人原因（如疏忽大意、违反交通规则等）导致的交通事故，那么医疗费用通常需由员工个人自行承担。此时，如果员工已参加基本医疗保险，其医疗费用可以按照医保报销范围和条件进行报销，医保基金将按规定比例支付相应费用。医保报销后的剩余部分，以及不属于医保报销范围的费用，则需由员工个人承担。
- 特殊情况：如果事故是由第三方（如其他车辆驾驶员）造成的，且该第三方负有赔偿责任，那么员工有权向第三方追偿医疗费用。在这种情况下，员工可以通过法律途径（如提起民事诉讼）来维护自己的合法权益。
建议与提醒：
- 及时申请工伤认定：如果员工在上下班途中发生事故，且怀疑该事故可能构成工伤，建议尽快向劳动保障部门提出工伤认定申请。申请时需提交工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料以及医疗诊断证明等。
- 保留相关证据：无论事故是否构成工伤，员工都应尽可能保留与事故相关的证据，如现场照片、证人证言、医疗记录等。这些证据在后续维权过程中将起到重要作用。
- 咨询专业律师：如果员工对事故是否构成工伤、医疗费用承担等问题存在疑问，建议直接向我咨询。我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，员工上下班发生事故医疗费的承担问题需根据事故是否构成工伤来具体分析。如果构成工伤，医疗费用主要由工伤保险基金或用人单位（未缴纳工伤保险时）承担；如果不构成工伤，则医疗费用主要通过医保报销，剩余部分由员工个人承担。在处理此类问题时，建议员工及时申请工伤认定并保留相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。